More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0016 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0016  ABC transporter related protein  100 
 
 
236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  29.61 
 
 
497 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  33.49 
 
 
240 aa  106  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1227  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  27.08 
 
 
246 aa  102  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0707636  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1274  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.63 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0385  ABC transporter related  29.91 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  28.23 
 
 
313 aa  97.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  32.57 
 
 
290 aa  94.4  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  26.29 
 
 
247 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  27.44 
 
 
287 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1152  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  26.17 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0979  ABC transporter ATP-binding protein EcsA  26.17 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1213  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  26.17 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1048  ABC transporter ATP-binding protein  26.17 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1084  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  26.17 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1462  ABC transporter related protein  26.51 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  28.18 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0958  ABC transporter, ATP-binding protein  26.17 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4220  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  26.17 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.183421  normal  0.0669124 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1125  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  26.17 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0968  ABC transporter, ATP-binding protein  26.17 
 
 
247 aa  92.8  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  27.23 
 
 
242 aa  92  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.64 
 
 
256 aa  91.7  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0645  ABC transporter related  26.48 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  27.06 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0751  ABC transporter related protein  22.58 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  32.09 
 
 
266 aa  88.6  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0007  ABC transporter related  32.09 
 
 
435 aa  88.2  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  27.52 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  26.94 
 
 
296 aa  87.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0409  ABC transporter related  32.31 
 
 
280 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00250472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0399  ABC transporter related  32.31 
 
 
280 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00135528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0815  ABC transporter-related protein  26.15 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  24.79 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2334  ABC transporter related protein  23.15 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00373453  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0415  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.37 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2537  ABC transporter related  29.56 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2589  ABC transporter related  29.56 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  28.77 
 
 
335 aa  85.5  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  25.7 
 
 
250 aa  85.1  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  24.47 
 
 
541 aa  85.1  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1924  ABC transporter related  28.38 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1890  ABC transporter related  28.38 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.670859  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  30.1 
 
 
307 aa  85.1  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  28.3 
 
 
541 aa  85.1  9e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  21.76 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  28.24 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0504  ABC transporter related  24.53 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930668  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  31.92 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  26.09 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  26.41 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  30.2 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  30.2 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  26.41 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  26.27 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0409  ABC transporter related protein  28.57 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  27.11 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0671  ABC transporter related  29.47 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  30.38 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  28.64 
 
 
293 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  26.89 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  28.04 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  27.06 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2021  ABC transporter related  27.59 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  24.67 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  25.11 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1988  ABC transporter related  27.59 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.854169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  31.1 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.06 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  27.06 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  29.41 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  27.06 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  25.7 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  27.06 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  28.97 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  25.7 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  29.41 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  27.8 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0784  ABC transporter related protein  27.88 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.217947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  26.61 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1475  ABC transporter, ATP-binding protein  26.07 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000651776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  26.67 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  25.13 
 
 
325 aa  82  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  23.48 
 
 
239 aa  82  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  30.66 
 
 
230 aa  82  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1262  ABC transporter related  25.12 
 
 
245 aa  82  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000313912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  25.85 
 
 
243 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  28.21 
 
 
305 aa  81.6  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1273  ABC transporter related  25 
 
 
318 aa  82  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  29.17 
 
 
328 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  26.61 
 
 
246 aa  81.6  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  25.46 
 
 
241 aa  81.6  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  25.52 
 
 
302 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  27.83 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  25.89 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.77 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  27.9 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3577  ABC transporter related  27.14 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  25.94 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>