49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0355 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0355  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 265 aa  555  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0677  chitooligosaccharide deacetylase-like  46.42 
 
 		 267 aa  271  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457424  unclonable  0.0000000136805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3729  polysaccharide deacetylase family protein  36.09 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1907  polysaccharide deacetylase  37.4 
 
 		 282 aa  168  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3116  polysaccharide deacetylase  33.58 
 
 		 267 aa  165  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0569329  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6253  polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  23.67 
 
 		 1748 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1097  polysaccharide deacetylase  24.7 
 
 		 422 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 705 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  28.35 
 
 		 404 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 1120 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2730  polysaccharide deacetylase  22.99 
 
 		 274 aa  48.9  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  36.25 
 
 		 413 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  24.49 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1098  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 380 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0232  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.621532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 699 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  34.25 
 
 		 1154 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  23.77 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  31.52 
 
 		 537 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  26.72 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 		 413 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  25.64 
 
 		 542 aa  42.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  24.17 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.25 
 
 		 1099 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 352 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  23.77 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  26.25 
 
 		 357 aa  42.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  24.43 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 267 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  24.43 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  22.96 
 
 		 234 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 409 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1105  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 278 aa  42  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>