22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6253 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6253  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 332 aa  671    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0355  polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0677  chitooligosaccharide deacetylase-like  34.85 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457424  unclonable  0.0000000136805 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1907  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3116  polysaccharide deacetylase  29.93 
 
 		 267 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0569329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3729  polysaccharide deacetylase family protein  27.61 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  23.85 
 
 		 1748 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 434 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1097  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 		 422 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 239 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  26.74 
 
 		 590 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 		 244 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 		 244 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 		 537 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2067  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1098  polysaccharide deacetylase  23.33 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 238 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  28.24 
 
 		 238 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 249 aa  42.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>