39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3729 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3729  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 259 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3116  polysaccharide deacetylase  68.97 
 
 		 267 aa  377  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0569329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0677  chitooligosaccharide deacetylase-like  36.43 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457424  unclonable  0.0000000136805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0355  polysaccharide deacetylase  36.09 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1907  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6253  polysaccharide deacetylase  27.61 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1702  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1836  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1880  putative polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.725748 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  27.33 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  27.33 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2571  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  27.07 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  22.35 
 
 		 1748 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  31.53 
 
 		 417 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 		 683 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0810  polysaccharide deacetylase family protein  36.25 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00210366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 320 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3917  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0823  polysaccharide deacetylase family protein  36.71 
 
 		 305 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000472378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 522 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1097  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 		 422 aa  45.8  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl558  putative chitin deacetylase  34.29 
 
 		 247 aa  45.8  0.0008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 		 537 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  32.88 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  28.21 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  22.5 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 		 289 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  23.9 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 479 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 		 309 aa  42  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0951  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 		 409 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0651013  normal  0.44667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>