172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0104 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0105  selenocysteine synthase  87.95 
 
 		 473 aa  844    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  97.27 
 
 		 476 aa  944    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0106  selenocysteine synthase  87.39 
 
 		 476 aa  849    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0101  selenocysteine synthase  87.53 
 
 		 473 aa  842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0106  selenocysteine synthase  87.39 
 
 		 476 aa  846    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  100 
 
 		 476 aa  971    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  100 
 
 		 476 aa  971    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0442  selenocysteine synthase  61.31 
 
 		 496 aa  548  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3919  selenocysteine synthase  55 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419812 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3897  selenocysteine synthase  53.51 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4068  selenocysteine synthase  53.29 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3961  selenocysteine synthase  53.29 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.481861 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3883  selenocysteine synthase  53.51 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.851696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4006  selenocysteine synthase  53.51 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4115  selenocysteine synthase  52.28 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0042  selenocysteine synthase  52.28 
 
 		 462 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03446  selenocysteine synthase  54.78 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0117  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  54.78 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4962  selenocysteine synthase  54.78 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.922888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4006  selenocysteine synthase  54.78 
 
 		 463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03397  hypothetical protein  54.78 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3796  selenocysteine synthase  54.78 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.915143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4089  selenocysteine synthase  54.57 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3766  selenocysteine synthase  52.4 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0122  selenocysteine synthase  54.78 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0090  selenocysteine synthase  53.04 
 
 		 463 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0140  selenocysteine synthase  53.28 
 
 		 463 aa  438  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2867  selenocysteine synthase  47.59 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2706  selenocysteine synthase  48.8 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  46.87 
 
 		 466 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0527  selenocysteine synthase  48.43 
 
 		 475 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0493  selenocysteine synthase  48.22 
 
 		 475 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6556  selenocysteine synthase  48.61 
 
 		 476 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0759041  decreased coverage  0.00101657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3486  selenocysteine synthase  46.94 
 
 		 484 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0801308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0548  selenocysteine synthase  48.28 
 
 		 475 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63540  selenocysteine synthase  47.87 
 
 		 468 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0658  selenocysteine synthase  49.48 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0487708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0536  selenocysteine synthase  48.52 
 
 		 475 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5527  selenocysteine synthase  47.95 
 
 		 468 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3540  selenocysteine synthase  46.72 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.607599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3988  selenocysteine synthase  46.55 
 
 		 479 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  44.49 
 
 		 465 aa  362  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3265  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  47.73 
 
 		 474 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.322866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3334  selenocysteine synthase  48.14 
 
 		 469 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.530246 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  52.62 
 
 		 480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  52.36 
 
 		 480 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  52.36 
 
 		 480 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  52.36 
 
 		 480 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  52.36 
 
 		 480 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  52.36 
 
 		 480 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  52.36 
 
 		 480 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2152  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  46.92 
 
 		 467 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3883  selenocysteine synthase  46.9 
 
 		 479 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3381  selenocysteine synthase  46.29 
 
 		 478 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  44.67 
 
 		 462 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1162  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  42.29 
 
 		 476 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103584 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2549  selenocysteine synthase  48.18 
 
 		 476 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  42.95 
 
 		 462 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4522  selenocysteine synthase  46.71 
 
 		 478 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  43.97 
 
 		 473 aa  336  5.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4593  selenocysteine synthase  46.46 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.263518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0711  selenocysteine synthase  53.4 
 
 		 495 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  42.92 
 
 		 462 aa  332  9e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2504  selenocysteine synthase  44.93 
 
 		 470 aa  328  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0196405  normal  0.0690834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4267  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  40.44 
 
 		 476 aa  326  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  41 
 
 		 475 aa  326  7e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0482  selenocysteine synthase  42.64 
 
 		 489 aa  323  6e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.112411  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5143  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  45.44 
 
 		 480 aa  323  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1646  selenocysteine synthase  45.81 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000318162  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0873  selenocysteine synthase  43.2 
 
 		 468 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3060  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  45.55 
 
 		 491 aa  317  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000814567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1311  selenocysteine synthase  48.1 
 
 		 506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207864 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0760  selenocysteine synthase  46.76 
 
 		 472 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306605  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0506  selenocysteine synthase  43.61 
 
 		 468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.487693  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  46.24 
 
 		 475 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4162  selenocysteine synthase  42.42 
 
 		 462 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3059  selenocysteine synthase  46.22 
 
 		 483 aa  308  9e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00615002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3796  selenocysteine synthase  41.4 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2096  selenocysteine synthase  45.85 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.247494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0440  selenocysteine synthase  39.62 
 
 		 491 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3879  selenocysteine synthase  41.65 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797755 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0812  L-seryl-tRNA selenium transferase  45.01 
 
 		 468 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2965  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  46.4 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  40.61 
 
 		 478 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4521  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  42.37 
 
 		 472 aa  299  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3369  selenocysteine synthase  42.07 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0412  selenocysteine synthase  40.38 
 
 		 491 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0441  selenocysteine synthase  39.41 
 
 		 491 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0831  selenocysteine synthase  44.62 
 
 		 449 aa  292  7e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.322314  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  47.02 
 
 		 470 aa  292  9e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25310  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  37.9 
 
 		 477 aa  291  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.362155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  40.95 
 
 		 473 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0819  selenocysteine synthase  41.43 
 
 		 461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0061  selenocysteine synthase  42.11 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1546  selenocysteine synthase  41.62 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0755  selenocysteine synthase  39.41 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2082  L-seryl-tRNA selenium transferase  39.3 
 
 		 445 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0765  L-seryl-tRNA selenium transferase  39.95 
 
 		 442 aa  272  9e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.522445  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0540  selenocysteine synthase  36.1 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2208  L-seryl-tRNA selenium transferase  40.51 
 
 		 519 aa  267  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.223965 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>