180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0482 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1311  selenocysteine synthase  78.69 
 
 		 506 aa  667    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0482  selenocysteine synthase  100 
 
 		 489 aa  973    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.112411  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3059  selenocysteine synthase  70.91 
 
 		 483 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00615002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0506  selenocysteine synthase  65.74 
 
 		 468 aa  558  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.487693  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0760  selenocysteine synthase  63.09 
 
 		 472 aa  546  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306605  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  62.08 
 
 		 475 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  54.94 
 
 		 462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  55.53 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  48.39 
 
 		 475 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1646  selenocysteine synthase  50.32 
 
 		 471 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000318162  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  47.96 
 
 		 462 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  52.76 
 
 		 473 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1162  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  44.96 
 
 		 476 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  47.96 
 
 		 462 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3796  selenocysteine synthase  49.05 
 
 		 468 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3369  selenocysteine synthase  53.25 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3879  selenocysteine synthase  49.24 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3060  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  48.52 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000814567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0819  selenocysteine synthase  50.33 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0061  selenocysteine synthase  52.8 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2504  selenocysteine synthase  50.96 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0196405  normal  0.0690834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4162  selenocysteine synthase  51.32 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0873  selenocysteine synthase  57.36 
 
 		 468 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2867  selenocysteine synthase  46.61 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  48.35 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  49.69 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0548  selenocysteine synthase  48.68 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4267  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  43.21 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000207221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0493  selenocysteine synthase  48.03 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2706  selenocysteine synthase  46.39 
 
 		 468 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  43.67 
 
 		 470 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25310  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  45.22 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.362155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0527  selenocysteine synthase  48.03 
 
 		 475 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0536  selenocysteine synthase  48.68 
 
 		 475 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3486  selenocysteine synthase  46.74 
 
 		 484 aa  362  9e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0801308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3919  selenocysteine synthase  46.62 
 
 		 463 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419812 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0831  selenocysteine synthase  41.16 
 
 		 449 aa  360  4e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.322314  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6556  selenocysteine synthase  47.19 
 
 		 476 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0759041  decreased coverage  0.00101657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5527  selenocysteine synthase  50.13 
 
 		 468 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4006  selenocysteine synthase  46.41 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63540  selenocysteine synthase  50.25 
 
 		 468 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3897  selenocysteine synthase  46.39 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4068  selenocysteine synthase  46.39 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3883  selenocysteine synthase  46.39 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.851696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3961  selenocysteine synthase  46.39 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.481861 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1692  L-seryl-tRNA selenium transferase  47.39 
 
 		 492 aa  350  4e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.624404  normal  0.735525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3766  selenocysteine synthase  44.37 
 
 		 462 aa  350  5e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0042  selenocysteine synthase  44.37 
 
 		 462 aa  349  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4115  selenocysteine synthase  44.37 
 
 		 462 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0440  selenocysteine synthase  46.74 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4089  selenocysteine synthase  46.84 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03446  selenocysteine synthase  46.84 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0117  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  46.84 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4962  selenocysteine synthase  46.84 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.922888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4006  selenocysteine synthase  46.84 
 
 		 463 aa  348  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03397  hypothetical protein  46.84 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0658  selenocysteine synthase  49.36 
 
 		 485 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0487708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3796  selenocysteine synthase  46.84 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.915143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0122  selenocysteine synthase  46.84 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2152  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  47.2 
 
 		 467 aa  346  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0412  selenocysteine synthase  46.23 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0441  selenocysteine synthase  51.25 
 
 		 491 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3540  selenocysteine synthase  47.95 
 
 		 479 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.607599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3988  selenocysteine synthase  47.95 
 
 		 479 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  53.23 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  53.23 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0812  L-seryl-tRNA selenium transferase  44.61 
 
 		 468 aa  341  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  53.23 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  53.23 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  53.23 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  53.23 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  43.83 
 
 		 465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  42.64 
 
 		 476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  42.64 
 
 		 476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  52.96 
 
 		 480 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0106  selenocysteine synthase  44.37 
 
 		 476 aa  339  7e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0101  selenocysteine synthase  44.37 
 
 		 473 aa  339  7e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0106  selenocysteine synthase  44.15 
 
 		 476 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0105  selenocysteine synthase  44.37 
 
 		 473 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  42.42 
 
 		 476 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3883  selenocysteine synthase  48.31 
 
 		 479 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2549  selenocysteine synthase  47.25 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4522  selenocysteine synthase  46.22 
 
 		 478 aa  335  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3381  selenocysteine synthase  47.4 
 
 		 478 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0140  selenocysteine synthase  45.79 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0090  selenocysteine synthase  43.87 
 
 		 463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2965  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  45.41 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158372  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11390  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  44.2 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.308467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0768  L-seryl-tRNA selenium transferase  44.05 
 
 		 469 aa  315  9e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.204194  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5143  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  52.91 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4521  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  44.49 
 
 		 472 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3334  selenocysteine synthase  48.8 
 
 		 469 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.530246 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1380  selenocysteine synthase  35.91 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.924415  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0711  selenocysteine synthase  51.97 
 
 		 495 aa  310  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1569  selenocysteine synthase  36.13 
 
 		 440 aa  305  9.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.339371  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0273  selenocysteine synthase  35.91 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4593  selenocysteine synthase  47.63 
 
 		 500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.263518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2208  L-seryl-tRNA selenium transferase  44.07 
 
 		 519 aa  302  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.223965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2096  selenocysteine synthase  46.97 
 
 		 479 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.247494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0540  selenocysteine synthase  36.5 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>