132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1821 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1821  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  100 
 
 		 215 aa  388  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1422  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  60.93 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0410862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  55.4 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  42.01 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0380  heme ABC transporter (heme exporter protein B), permease protein (cytochrome c biogenesis)  42.73 
 
 		 222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0321  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  43.38 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  42.47 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  39.09 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  39.09 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0410  heme exporter protein CcmB  42.92 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  38.53 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  37.5 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  41.1 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  43.18 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  37.5 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  35.19 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  35.19 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  35.19 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  35.48 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  35.19 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  36.28 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  35.19 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  34.88 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  35.19 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  35.19 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  34.56 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  35.48 
 
 		 241 aa  98.6  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  37.63 
 
 		 237 aa  98.6  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  36.24 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  35.02 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  34.72 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  40.93 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  35.81 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  39.22 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  34.62 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4189  heme exporter protein CcmB  39.17 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0095  heme exporter protein CcmB  38.94 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0093  heme exporter protein CcmB  38.94 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  36.74 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  36.74 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  38.14 
 
 		 219 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  36.74 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3740  heme exporter protein CcmB  38.25 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  38.14 
 
 		 219 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  36.74 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  36.74 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  36.74 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  36.74 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  36.74 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  36.74 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4063  heme exporter protein CcmB  37.33 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  38.14 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  38.14 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0214  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  40.28 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3085  heme exporter protein CcmB  37.04 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  38.98 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  40.72 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0107  heme exporter protein CcmB  36.92 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1285  heme exporter protein CcmB  31.03 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.583971  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  38.57 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  38.57 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2058  heme exporter protein CcmB  45.11 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  36.42 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  36.79 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  38.1 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  38.1 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  38.1 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  38.1 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  36.42 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  36.36 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03073  ABC type heme exporter, permease subunit ccmB  33.52 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2112  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  33.81 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3507  heme exporter protein CcmB  40.68 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00483881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  38.89 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  33.65 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  35.75 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0371  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  36.15 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000646849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3854  heme exporter protein CcmB  35.68 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1828  ABC exporter, inner membrane subunit CcmB  33.33 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2165  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  33.02 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  36.53 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  36.06 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1000  heme exporter protein CcmB  38.71 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  31.16 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  36.52 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  37.31 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1179  heme exporter protein CcmB  38.55 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  35.71 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3359  heme exporter protein CcmB  35.35 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428461  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1412  heme exporter protein CcmB  40.46 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451001  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  38.86 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  36.6 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1854  heme exporter protein B  42.14 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116967  normal  0.847567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  35.83 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1644  heme exporter protein B  35.94 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  41.67 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3414  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  33.55 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  33.88 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  33.88 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  35.23 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>