148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06063 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  100 
 
 
231 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  100 
 
 
231 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1561  heme exporter protein CcmB  70.56 
 
 
231 aa  238  6.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.195545  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1618  heme ABC transporter membrane protein  69.7 
 
 
231 aa  223  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0662313  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2700  heme exporter protein CcmB  77.33 
 
 
231 aa  208  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.410866  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  45.29 
 
 
228 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  45.29 
 
 
228 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  45.29 
 
 
228 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  45.29 
 
 
228 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  45.29 
 
 
228 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  45.29 
 
 
228 aa  175  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  44.39 
 
 
228 aa  175  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  44.84 
 
 
228 aa  174  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  44.39 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  44.39 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  44.39 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  43.05 
 
 
228 aa  168  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  45.29 
 
 
228 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  45.74 
 
 
228 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  45.29 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  46.19 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  44.29 
 
 
241 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  43.42 
 
 
239 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  43.69 
 
 
222 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  47.09 
 
 
222 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  49.06 
 
 
228 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  45.83 
 
 
222 aa  141  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  40.49 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  46.5 
 
 
237 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  51.39 
 
 
223 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  41.82 
 
 
221 aa  138  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  49.3 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  43.32 
 
 
221 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  43.32 
 
 
221 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  42.4 
 
 
222 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  45.45 
 
 
222 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  41.18 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0460  heme exporter protein CcmB  51.58 
 
 
218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421512  normal  0.196055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  42.79 
 
 
219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1802  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  51.05 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.813429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0448  heme exporter protein CcmB  51.05 
 
 
218 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  41.63 
 
 
219 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  41.63 
 
 
219 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  39.55 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  41.47 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  40.47 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  50 
 
 
225 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  39.63 
 
 
222 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1684  heme exporter protein CcmB  46.39 
 
 
222 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  44.81 
 
 
222 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  39.81 
 
 
219 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  39.81 
 
 
219 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  46.77 
 
 
222 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  39.35 
 
 
222 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  41.23 
 
 
218 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  39.44 
 
 
222 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  41.23 
 
 
218 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3392  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  50.71 
 
 
223 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1578  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  49.53 
 
 
222 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  41.23 
 
 
218 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  41.23 
 
 
218 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  39.91 
 
 
222 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  40.76 
 
 
218 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  40.76 
 
 
218 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  43.06 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  46.76 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3414  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  36.32 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  43.06 
 
 
222 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1412  heme exporter protein CcmB  45.13 
 
 
218 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451001  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1000  heme exporter protein CcmB  43.52 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298258  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  43.32 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45370  heme exporter protein CcmB  49.76 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30440  Cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  50.93 
 
 
223 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0380  heme ABC transporter (heme exporter protein B), permease protein (cytochrome c biogenesis)  40.55 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969313 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1285  heme exporter protein CcmB  34.18 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.583971  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  39.44 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3359  heme exporter protein CcmB  44.75 
 
 
221 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03073  ABC type heme exporter, permease subunit ccmB  39.25 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  39.17 
 
 
222 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  41.4 
 
 
221 aa  112  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0371  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  41.86 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000646849 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1033  heme exporter protein CcmB  42.36 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4767  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  45.37 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2790  heme exporter protein CcmB  51.87 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  0.555679 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  39.34 
 
 
220 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  39.34 
 
 
220 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  39.34 
 
 
220 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  39.34 
 
 
220 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  39.34 
 
 
220 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  39.34 
 
 
220 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  39.34 
 
 
220 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  39.34 
 
 
220 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  39.34 
 
 
220 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  46.3 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4189  heme exporter protein CcmB  38.5 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3851  heme exporter protein CcmB  49.76 
 
 
223 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0321  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  38.25 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1179  heme exporter protein CcmB  43.4 
 
 
221 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3085  heme exporter protein CcmB  37.21 
 
 
219 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0410  heme exporter protein CcmB  37.33 
 
 
222 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>