135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1828 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1828  ABC exporter, inner membrane subunit CcmB  100 
 
 		 245 aa  462  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2112  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  92.24 
 
 		 241 aa  422  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2165  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  83.91 
 
 		 236 aa  349  3e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  37.39 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  36.24 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  35.37 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  35.81 
 
 		 228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  35.24 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  35.96 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  34.36 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  35.96 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  34.36 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  34.36 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  34.8 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  34.36 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  33.92 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  35.53 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  35.53 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  34.7 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  32.9 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  33.94 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  32.26 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  33.65 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  31.75 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  31.7 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  31.7 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3414  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  33.87 
 
 		 213 aa  95.9  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  34.84 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  35.35 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  35.91 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  35.2 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  34.48 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  31.94 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  35.91 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  35.91 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03073  ABC type heme exporter, permease subunit ccmB  32.96 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  35.91 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  35.91 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  32.7 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  35.24 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  32.55 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  35.62 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  35.62 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  32.08 
 
 		 222 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  35.62 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30440  Cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  37.44 
 
 		 223 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  32.08 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  35.62 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  35.62 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  35.62 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  35.62 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  35.62 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  35.62 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1684  heme exporter protein CcmB  36.22 
 
 		 222 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  33.33 
 
 		 222 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  36.2 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1578  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  38.36 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  32.87 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  32.97 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3507  heme exporter protein CcmB  35.11 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00483881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1033  heme exporter protein CcmB  32.22 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.93 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0371  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  32.08 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000646849 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1644  heme exporter protein B  35.75 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  36.6 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2790  heme exporter protein CcmB  37.9 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  34.72 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  34.23 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  30.09 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2727  heme exporter protein CcmB  38.03 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  34.23 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1388  heme exporter protein CcmB  36.99 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0394  heme exporter protein B  36.99 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1497  heme exporter protein CcmB  36.99 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  34.09 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  34.23 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2423  heme exporter protein CcmB  38.25 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  34.23 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  34.23 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  34.23 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  34.83 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  27.85 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  34.25 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  30.98 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  30.98 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  37.63 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4326  heme exporter protein CcmB  38.38 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  29.63 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  29.63 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1285  heme exporter protein CcmB  27.01 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.583971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1422  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  34.52 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0410862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3652  heme exporter protein CcmB  38.38 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3392  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  35.19 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0947  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  34.76 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1179  heme exporter protein CcmB  34.27 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0410  heme exporter protein CcmB  29.3 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  29.35 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0321  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  29.72 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  38.31 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4767  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  33.02 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>