144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0293 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  100 
 
 		 222 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  95.95 
 
 		 222 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  93.69 
 
 		 222 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  87.39 
 
 		 222 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0410  heme exporter protein CcmB  86.49 
 
 		 222 aa  341  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0321  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  86.04 
 
 		 222 aa  338  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0380  heme ABC transporter (heme exporter protein B), permease protein (cytochrome c biogenesis)  86.49 
 
 		 222 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  60.56 
 
 		 222 aa  231  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3085  heme exporter protein CcmB  64.52 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  59.62 
 
 		 222 aa  228  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3854  heme exporter protein CcmB  65.88 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  59.15 
 
 		 222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3740  heme exporter protein CcmB  62.21 
 
 		 219 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4063  heme exporter protein CcmB  61.75 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  55.96 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  55.96 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4189  heme exporter protein CcmB  61.75 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1179  heme exporter protein CcmB  61.26 
 
 		 221 aa  205  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0095  heme exporter protein CcmB  60.27 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0093  heme exporter protein CcmB  60.27 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  55.67 
 
 		 222 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3359  heme exporter protein CcmB  58.45 
 
 		 221 aa  197  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0107  heme exporter protein CcmB  58.94 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  46.08 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  46.08 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3507  heme exporter protein CcmB  54.79 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00483881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  46.08 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  46.08 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1285  heme exporter protein CcmB  44.79 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.583971  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  46.7 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  45.62 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  45.62 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  45.62 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  45.62 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  46.08 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  45.62 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  45.62 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  46.08 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  45.62 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  45.62 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  45.16 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  46.54 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1000  heme exporter protein CcmB  49.07 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1412  heme exporter protein CcmB  52.41 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451001  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  47.64 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  40.91 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  45.66 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  40.51 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  41.51 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  43.85 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  45.83 
 
 		 219 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  44.7 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  47.32 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  43.12 
 
 		 241 aa  134  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  47 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  43.12 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  45.19 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  44.71 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  44.71 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  45.19 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  43.12 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  41.89 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  41.82 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  42.59 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1405  heme exporter protein CcmB  54.26 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  46.51 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1684  heme exporter protein CcmB  45.99 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0448  heme exporter protein CcmB  48.42 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0460  heme exporter protein CcmB  48.42 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421512  normal  0.196055 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1802  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  47.89 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.813429  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0214  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  41.74 
 
 		 217 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  44.71 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  44.71 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  44.23 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0371  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  40.28 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000646849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  44.23 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  44.23 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  44.23 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  44.91 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1644  heme exporter protein B  45.87 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  42.92 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  42.92 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  42.92 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  42.92 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  42.92 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  42.92 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  42.92 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  42.92 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  42.92 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  45.58 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  43.52 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  44 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  38.97 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  38.97 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4988  heme exporter protein CcmB  43.24 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1033  heme exporter protein CcmB  44.34 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  47.54 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1854  heme exporter protein B  52.33 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116967  normal  0.847567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  40.18 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  48.19 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>