148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0044 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  100 
 
 		 227 aa  411  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  62.62 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  62.84 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  66.51 
 
 		 219 aa  228  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  62.27 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  53.51 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  51.75 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  51.75 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  51.75 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  51.75 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  59.7 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  51.75 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  51.77 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  50.88 
 
 		 228 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  50.88 
 
 		 228 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  50.88 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  54.42 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  54.82 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  54.46 
 
 		 228 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  53.1 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  59.03 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  54.35 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  56.64 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  53.07 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  53.77 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  60.91 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  62.19 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  53.42 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0371  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  55.3 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000646849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  54.34 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  53.88 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  47.75 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  54.42 
 
 		 222 aa  178  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  53.42 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  50 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  51.36 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  47 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  50.23 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  46.15 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4767  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  56.48 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  47.87 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  47.87 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0380  heme ABC transporter (heme exporter protein B), permease protein (cytochrome c biogenesis)  48.42 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  47.39 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  47.39 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1684  heme exporter protein CcmB  51.04 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  50 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  47.47 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1033  heme exporter protein CcmB  53.99 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0410  heme exporter protein CcmB  47.96 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  49.77 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  47.87 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  47.87 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  56.05 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  46.05 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  47.87 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  47.87 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0321  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  47.51 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  47.39 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  48.15 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  47.39 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  46.54 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1644  heme exporter protein B  52.29 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  45.12 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  45.12 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  46.76 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  46.76 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  46.98 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  46.98 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  46.98 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  46.98 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  46.98 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  46.98 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  46.98 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  46.98 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  46.98 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  52.04 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  48.63 
 
 		 222 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  46.77 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2727  heme exporter protein CcmB  55.19 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0214  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  46.33 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1388  heme exporter protein CcmB  52.75 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0394  heme exporter protein B  52.75 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1497  heme exporter protein CcmB  52.75 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2423  heme exporter protein CcmB  54.72 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1412  heme exporter protein CcmB  53.85 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451001  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1179  heme exporter protein CcmB  47.25 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0947  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  52.86 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1000  heme exporter protein CcmB  46.33 
 
 		 218 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45370  heme exporter protein CcmB  55.61 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1285  heme exporter protein CcmB  40 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.583971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4003  heme exporter protein CcmB  58.6 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3854  heme exporter protein CcmB  45.16 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3085  heme exporter protein CcmB  43.24 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1578  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  52.61 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30440  Cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  54.75 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  44.22 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0460  heme exporter protein CcmB  48.95 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421512  normal  0.196055 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0448  heme exporter protein CcmB  48.42 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2790  heme exporter protein CcmB  54.3 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  0.555679 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>