147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2493 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  100 
 
 
218 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  100 
 
 
218 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  99.08 
 
 
218 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  99.54 
 
 
218 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  99.54 
 
 
218 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  99.08 
 
 
218 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  98.62 
 
 
219 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  98.62 
 
 
219 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  97.71 
 
 
219 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  97.71 
 
 
219 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  85.25 
 
 
220 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  85.25 
 
 
220 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  85.25 
 
 
220 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  85.25 
 
 
220 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  85.25 
 
 
220 aa  301  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  85.25 
 
 
220 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  85.25 
 
 
220 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  85.25 
 
 
220 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  85.25 
 
 
220 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  71.56 
 
 
219 aa  248  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  61.61 
 
 
228 aa  239  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  61.14 
 
 
228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  61.14 
 
 
228 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  61.14 
 
 
228 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  61.14 
 
 
228 aa  237  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  61.14 
 
 
228 aa  237  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  61.14 
 
 
228 aa  237  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  61.14 
 
 
228 aa  237  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  61.14 
 
 
228 aa  237  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  60.47 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  58.77 
 
 
228 aa  228  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  56.22 
 
 
228 aa  228  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  65.4 
 
 
222 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  60.19 
 
 
228 aa  221  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  62.09 
 
 
222 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  62.09 
 
 
222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  58.29 
 
 
228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  58.29 
 
 
228 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  58.29 
 
 
228 aa  211  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1388  heme exporter protein CcmB  73.93 
 
 
219 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0394  heme exporter protein B  73.93 
 
 
219 aa  210  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1497  heme exporter protein CcmB  73.93 
 
 
219 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2727  heme exporter protein CcmB  70.18 
 
 
218 aa  209  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2423  heme exporter protein CcmB  70.64 
 
 
218 aa  207  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1644  heme exporter protein B  66.35 
 
 
222 aa  203  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  61.14 
 
 
221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  56.88 
 
 
222 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  51.83 
 
 
241 aa  174  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  52.11 
 
 
222 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1033  heme exporter protein CcmB  56.28 
 
 
271 aa  165  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  46.26 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  46.79 
 
 
222 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  50 
 
 
222 aa  161  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  46.53 
 
 
237 aa  161  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  47.66 
 
 
222 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  54.29 
 
 
223 aa  158  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  49.3 
 
 
222 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  49.05 
 
 
221 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  42.93 
 
 
206 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  46.73 
 
 
222 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  49.05 
 
 
221 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03073  ABC type heme exporter, permease subunit ccmB  53.55 
 
 
221 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  44.55 
 
 
221 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  49.3 
 
 
222 aa  148  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  47.87 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  55.45 
 
 
225 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  48.82 
 
 
222 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  47.39 
 
 
222 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  47.39 
 
 
222 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  44.71 
 
 
222 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  44.71 
 
 
222 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0371  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  42.99 
 
 
222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000646849 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  46.45 
 
 
228 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  54.5 
 
 
222 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  50.57 
 
 
222 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0380  heme ABC transporter (heme exporter protein B), permease protein (cytochrome c biogenesis)  46.15 
 
 
222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1000  heme exporter protein CcmB  45.5 
 
 
218 aa  135  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298258  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0321  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  47.6 
 
 
222 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  46.15 
 
 
222 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1578  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  55.71 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  47.72 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3854  heme exporter protein CcmB  50.96 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174193  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  47.87 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0410  heme exporter protein CcmB  46.63 
 
 
222 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1802  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  48.95 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.813429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  45.67 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45370  heme exporter protein CcmB  55.12 
 
 
223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30440  Cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  53.85 
 
 
223 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0448  heme exporter protein CcmB  48.95 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  41.23 
 
 
231 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  41.23 
 
 
231 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0460  heme exporter protein CcmB  49.47 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421512  normal  0.196055 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0947  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  56.22 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3507  heme exporter protein CcmB  48.24 
 
 
239 aa  125  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00483881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3740  heme exporter protein CcmB  44.75 
 
 
219 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2058  heme exporter protein CcmB  50.25 
 
 
226 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3085  heme exporter protein CcmB  42.73 
 
 
219 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4063  heme exporter protein CcmB  44.2 
 
 
219 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405961  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4189  heme exporter protein CcmB  42.66 
 
 
219 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3652  heme exporter protein CcmB  54.73 
 
 
222 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>