148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3255 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  100 
 
 		 222 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  58.9 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  60 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  59.36 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  59.36 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  59.36 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  59.36 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  58.9 
 
 		 228 aa  248  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  58.37 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  58.37 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  58.9 
 
 		 228 aa  248  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  59.36 
 
 		 228 aa  246  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  59.36 
 
 		 228 aa  245  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  59.82 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  61.4 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03073  ABC type heme exporter, permease subunit ccmB  71.43 
 
 		 221 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  58.82 
 
 		 228 aa  234  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  60.38 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  57.67 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  56.68 
 
 		 222 aa  198  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  53.92 
 
 		 222 aa  197  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  53.88 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  51.85 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  51.85 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  52.34 
 
 		 219 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  52.34 
 
 		 219 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  52.97 
 
 		 222 aa  195  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  55.4 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1644  heme exporter protein B  56.34 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  45.05 
 
 		 222 aa  184  7e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  52.34 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  52.34 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  52.34 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  52.34 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1033  heme exporter protein CcmB  56.28 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  55.87 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  55.87 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  51.87 
 
 		 218 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  51.87 
 
 		 218 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  55.87 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  55.87 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  55.87 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  55.87 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  55.87 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  55.87 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  55.87 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  47.93 
 
 		 241 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  46.31 
 
 		 206 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  47.47 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  44.34 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  52.11 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  47.25 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  44.06 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  42.4 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  42.4 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1388  heme exporter protein CcmB  57.48 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0394  heme exporter protein B  57.48 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1497  heme exporter protein CcmB  57.48 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  42.59 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  47.22 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2423  heme exporter protein CcmB  58.8 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2727  heme exporter protein CcmB  58.8 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  52.97 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  43.06 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  45.21 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  40.18 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  40.18 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  46.48 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  41.67 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  39.81 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  38.74 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  44.09 
 
 		 222 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  48.13 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  43.06 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1684  heme exporter protein CcmB  48.9 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0371  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  42.52 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000646849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0380  heme ABC transporter (heme exporter protein B), permease protein (cytochrome c biogenesis)  42.13 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  43.64 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  48.64 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  50.93 
 
 		 222 aa  151  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  42.13 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0410  heme exporter protein CcmB  42.13 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0321  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  42.13 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0214  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  42.99 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  41.58 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4767  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  47.25 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  45.23 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3085  heme exporter protein CcmB  41.1 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3740  heme exporter protein CcmB  38.36 
 
 		 219 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3414  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  41.75 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4189  heme exporter protein CcmB  38.71 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4063  heme exporter protein CcmB  37.44 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1285  heme exporter protein CcmB  35.48 
 
 		 221 aa  134  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.583971  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0947  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  50.23 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2058  heme exporter protein CcmB  45.63 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30440  Cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  47.73 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3359  heme exporter protein CcmB  39.78 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0107  heme exporter protein CcmB  39.61 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3854  heme exporter protein CcmB  38.86 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0095  heme exporter protein CcmB  38.36 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>