142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4063 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4063  heme exporter protein CcmB  100 
 
 
219 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405961  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3740  heme exporter protein CcmB  96.8 
 
 
219 aa  360  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4189  heme exporter protein CcmB  90.41 
 
 
219 aa  341  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3085  heme exporter protein CcmB  85.84 
 
 
219 aa  330  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0095  heme exporter protein CcmB  74.66 
 
 
221 aa  279  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0093  heme exporter protein CcmB  74.66 
 
 
221 aa  279  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0107  heme exporter protein CcmB  77.03 
 
 
221 aa  268  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3359  heme exporter protein CcmB  70.33 
 
 
221 aa  262  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  61.75 
 
 
222 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0380  heme ABC transporter (heme exporter protein B), permease protein (cytochrome c biogenesis)  62.56 
 
 
222 aa  243  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  58.53 
 
 
222 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0410  heme exporter protein CcmB  62.1 
 
 
222 aa  236  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0321  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  61.64 
 
 
222 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  60.83 
 
 
222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  60.37 
 
 
222 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  59.62 
 
 
222 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  57.21 
 
 
222 aa  222  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  56.07 
 
 
221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  56.07 
 
 
221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  56.34 
 
 
222 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3854  heme exporter protein CcmB  61.08 
 
 
223 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174193  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  55.28 
 
 
222 aa  188  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1285  heme exporter protein CcmB  47.12 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.583971  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1179  heme exporter protein CcmB  57.99 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3507  heme exporter protein CcmB  57.8 
 
 
239 aa  175  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00483881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  48.57 
 
 
228 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  48.31 
 
 
228 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  47.19 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  47.75 
 
 
228 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  47.75 
 
 
228 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  47.75 
 
 
228 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  47.75 
 
 
228 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  47.75 
 
 
228 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  47.75 
 
 
228 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  47.19 
 
 
228 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  47.75 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  41.59 
 
 
228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  42.13 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  46.63 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  47.19 
 
 
228 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1412  heme exporter protein CcmB  50.27 
 
 
218 aa  141  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451001  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  45 
 
 
228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  46.07 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  43.5 
 
 
222 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  39.88 
 
 
206 aa  135  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  43.52 
 
 
241 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  42.7 
 
 
221 aa  132  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  44.75 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  44.75 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  44.75 
 
 
219 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  44.75 
 
 
219 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  40.76 
 
 
239 aa  128  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  45.09 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  45.09 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1405  heme exporter protein CcmB  55.84 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  44.51 
 
 
218 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  44.51 
 
 
218 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  44.51 
 
 
218 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  44.51 
 
 
218 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  49.14 
 
 
219 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  39.11 
 
 
231 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1000  heme exporter protein CcmB  45 
 
 
218 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298258  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  39.11 
 
 
231 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  42.86 
 
 
222 aa  121  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  37.44 
 
 
222 aa  121  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  42.4 
 
 
222 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  44.57 
 
 
222 aa  117  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0460  heme exporter protein CcmB  47.62 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421512  normal  0.196055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  43.4 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  43.4 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  43.4 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  43.4 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  43.4 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  43.4 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  43.4 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  43.4 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  43.4 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  41.53 
 
 
222 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  44.19 
 
 
222 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  46.07 
 
 
227 aa  115  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  38.07 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1802  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  46.03 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.813429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  43.11 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0448  heme exporter protein CcmB  46.03 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  41.78 
 
 
221 aa  112  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  44.57 
 
 
219 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  42.86 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  43.65 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1561  heme exporter protein CcmB  43.62 
 
 
231 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.195545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  43.65 
 
 
222 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1618  heme ABC transporter membrane protein  43.62 
 
 
231 aa  108  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0662313  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  47.95 
 
 
225 aa  108  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  41.48 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1684  heme exporter protein CcmB  39.46 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1854  heme exporter protein B  44.68 
 
 
218 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116967  normal  0.847567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  45.98 
 
 
222 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0214  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  36.28 
 
 
217 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1033  heme exporter protein CcmB  47.95 
 
 
271 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4988  heme exporter protein CcmB  37.5 
 
 
221 aa  101  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  43.09 
 
 
223 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>