146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0947 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0947  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  100 
 
 
234 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  56.95 
 
 
228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  56.95 
 
 
228 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  56.95 
 
 
228 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  56.95 
 
 
228 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  56.95 
 
 
228 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  57.4 
 
 
228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  56.5 
 
 
228 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  56.5 
 
 
228 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  56.5 
 
 
228 aa  236  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  56.05 
 
 
228 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  57.4 
 
 
228 aa  234  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  54.71 
 
 
228 aa  228  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  56.5 
 
 
228 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  54.71 
 
 
228 aa  215  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  53.95 
 
 
228 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  54.02 
 
 
228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  57.55 
 
 
241 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  57.01 
 
 
219 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  57.01 
 
 
219 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  56.13 
 
 
219 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  56.13 
 
 
219 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  54 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  57.55 
 
 
218 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  57.55 
 
 
218 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  56.22 
 
 
218 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  56.22 
 
 
218 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  50.97 
 
 
206 aa  194  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  57.08 
 
 
218 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  57.08 
 
 
218 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  49.1 
 
 
222 aa  192  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  55.3 
 
 
219 aa  192  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  57.55 
 
 
219 aa  191  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  53.95 
 
 
221 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  51.66 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1033  heme exporter protein CcmB  59.19 
 
 
271 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  55.4 
 
 
222 aa  189  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  54.72 
 
 
222 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  61.97 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  53.92 
 
 
222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  53.05 
 
 
222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  54.38 
 
 
220 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  54.38 
 
 
220 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  54.38 
 
 
220 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  54.38 
 
 
220 aa  179  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  54.38 
 
 
220 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  54.38 
 
 
220 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  54.38 
 
 
220 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  54.38 
 
 
220 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  54.38 
 
 
220 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  53.12 
 
 
228 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  55.4 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  53.77 
 
 
223 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  54.34 
 
 
222 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1644  heme exporter protein B  54.72 
 
 
222 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  50.7 
 
 
222 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  46.3 
 
 
222 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  54.82 
 
 
222 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  53.49 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  47.98 
 
 
231 aa  164  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  47.98 
 
 
231 aa  164  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  51.42 
 
 
222 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  46.63 
 
 
222 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  46.15 
 
 
222 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1578  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  57.94 
 
 
222 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1684  heme exporter protein CcmB  51.04 
 
 
222 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30440  Cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  58.41 
 
 
223 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  50.95 
 
 
222 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  45.5 
 
 
221 aa  158  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  45.5 
 
 
221 aa  158  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  55.25 
 
 
222 aa  157  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  43.06 
 
 
222 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  51.2 
 
 
222 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0371  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  45.33 
 
 
222 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000646849 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1388  heme exporter protein CcmB  55.4 
 
 
219 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0394  heme exporter protein B  55.4 
 
 
219 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1497  heme exporter protein CcmB  55.4 
 
 
219 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  47.34 
 
 
222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45370  heme exporter protein CcmB  57.07 
 
 
223 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2790  heme exporter protein CcmB  58.37 
 
 
223 aa  148  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  41.71 
 
 
222 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03073  ABC type heme exporter, permease subunit ccmB  48.11 
 
 
221 aa  146  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0214  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  46.08 
 
 
217 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3652  heme exporter protein CcmB  59.7 
 
 
222 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4326  heme exporter protein CcmB  59.7 
 
 
222 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  43.54 
 
 
222 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4767  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  52.83 
 
 
222 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1000  heme exporter protein CcmB  46.23 
 
 
218 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298258  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  46.15 
 
 
222 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  43.06 
 
 
222 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2727  heme exporter protein CcmB  52.09 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2423  heme exporter protein CcmB  53.3 
 
 
218 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0410  heme exporter protein CcmB  42.65 
 
 
222 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3851  heme exporter protein CcmB  57.07 
 
 
223 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3392  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  52.49 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1412  heme exporter protein CcmB  55.06 
 
 
218 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451001  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0380  heme ABC transporter (heme exporter protein B), permease protein (cytochrome c biogenesis)  41.23 
 
 
222 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0321  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  45.25 
 
 
222 aa  135  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1405  heme exporter protein CcmB  50.79 
 
 
225 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3414  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  42.16 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>