146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3652 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4326  heme exporter protein CcmB  99.1 
 
 		 222 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3652  heme exporter protein CcmB  100 
 
 		 222 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1541  heme exporter protein CcmB  98.65 
 
 		 222 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3895  heme exporter protein CcmB  99.1 
 
 		 222 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0364758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  84.16 
 
 		 223 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1578  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  90.09 
 
 		 222 aa  279  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30440  Cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  89.14 
 
 		 223 aa  267  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45370  heme exporter protein CcmB  90.05 
 
 		 223 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2790  heme exporter protein CcmB  90.95 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3392  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  87.78 
 
 		 223 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3851  heme exporter protein CcmB  89.59 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  55 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  55 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  55.5 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  55.5 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  55.5 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  55.5 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  55.5 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  55.5 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  55.5 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  55.96 
 
 		 228 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  53.67 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  52.75 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  55.96 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  55.96 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  55 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  55.05 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  57.34 
 
 		 219 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  55.4 
 
 		 222 aa  191  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  55.87 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  54.29 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  54.29 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  53.81 
 
 		 219 aa  187  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  53.81 
 
 		 219 aa  187  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  48.53 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  48.17 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  52.97 
 
 		 222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  54.29 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  54.29 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  54.29 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  54.29 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  48.64 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  53.81 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  53.81 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  56.07 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  55.05 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  55.05 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  55.05 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  55.05 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  55.05 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  55.05 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  55.05 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  55.05 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  55.05 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  51.24 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  52.11 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  52.11 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  52.56 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1033  heme exporter protein CcmB  58.26 
 
 		 271 aa  174  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1644  heme exporter protein B  55.91 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  51.13 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  61.19 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  50 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  50.68 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1388  heme exporter protein CcmB  57.8 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0394  heme exporter protein B  57.8 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1497  heme exporter protein CcmB  57.8 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  54.13 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  51.61 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  53 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  49.53 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  50 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1684  heme exporter protein CcmB  52.08 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2727  heme exporter protein CcmB  57.01 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  55.25 
 
 		 222 aa  154  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  47.17 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  49.07 
 
 		 222 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2423  heme exporter protein CcmB  56.54 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  44.55 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  44.55 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0371  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  48.83 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000646849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  53.77 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  43.12 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  43.58 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  43.32 
 
 		 222 aa  148  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0947  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  58.49 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  47.25 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  47.51 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  48.36 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03073  ABC type heme exporter, permease subunit ccmB  47.09 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1561  heme exporter protein CcmB  49.49 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.195545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3414  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  42.92 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  44.5 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  44.5 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1000  heme exporter protein CcmB  46.76 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  46.04 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0380  heme ABC transporter (heme exporter protein B), permease protein (cytochrome c biogenesis)  44.5 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969313 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1618  heme ABC transporter membrane protein  49.49 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0662313  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0919  heme exporter protein CcmB  44.81 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0888  heme exporter protein CcmB  44.81 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>