145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3851 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3851  heme exporter protein CcmB  100 
 
 		 223 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45370  heme exporter protein CcmB  99.1 
 
 		 223 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  83.86 
 
 		 223 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1578  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  89.59 
 
 		 222 aa  275  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30440  Cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  89.24 
 
 		 223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2790  heme exporter protein CcmB  90.13 
 
 		 223 aa  263  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3392  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  87 
 
 		 223 aa  255  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4326  heme exporter protein CcmB  90.2 
 
 		 222 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3652  heme exporter protein CcmB  90.2 
 
 		 222 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3895  heme exporter protein CcmB  91.18 
 
 		 222 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0364758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1541  heme exporter protein CcmB  90.69 
 
 		 222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  54.75 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  53.85 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  53.85 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  53.85 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  53.39 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  53.39 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  53.39 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  53.39 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  52.94 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  52.94 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  54.09 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  53.21 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  54.3 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  53.39 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  52.94 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  54.09 
 
 		 228 aa  195  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  54.17 
 
 		 241 aa  194  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  48.64 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  56.42 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  53.64 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  53.85 
 
 		 219 aa  187  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  53.85 
 
 		 219 aa  187  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  53.85 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  53.85 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  49.51 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  52.27 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  53.23 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  53.92 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  52.7 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  53.85 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  53.85 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  53.85 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  53.85 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  55.66 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  53.39 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  53.39 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  49.53 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  59.28 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  57.14 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  57.14 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  57.14 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  57.14 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  50.23 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  50.23 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  57.14 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  57.14 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  57.14 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  57.14 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  57.14 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1644  heme exporter protein B  56.11 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  52.04 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1033  heme exporter protein CcmB  56.82 
 
 		 271 aa  170  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  55.4 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  50.45 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  50.91 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  51.13 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  46.12 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  46.12 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  52.53 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1684  heme exporter protein CcmB  52.58 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  59.46 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  48.87 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  48.87 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  50.28 
 
 		 222 aa  157  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1388  heme exporter protein CcmB  56.42 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0394  heme exporter protein B  56.42 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1497  heme exporter protein CcmB  56.42 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  43.44 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  46.81 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2727  heme exporter protein CcmB  57.01 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2423  heme exporter protein CcmB  57.01 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  47.06 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  47.12 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  52.26 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3414  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  44.34 
 
 		 213 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0947  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  55.25 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  48.4 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0371  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  47.42 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000646849 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  47.73 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  42.92 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1000  heme exporter protein CcmB  47.42 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298258  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0919  heme exporter protein CcmB  45.87 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0888  heme exporter protein CcmB  45.87 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0380  heme ABC transporter (heme exporter protein B), permease protein (cytochrome c biogenesis)  45.75 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1405  heme exporter protein CcmB  57.89 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4767  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  52.13 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1561  heme exporter protein CcmB  47.47 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.195545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  44.81 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  44.81 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>