146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1405 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1405  heme exporter protein CcmB  100 
 
 		 225 aa  407  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  57.4 
 
 		 222 aa  224  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  58.82 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  56.56 
 
 		 222 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  53.64 
 
 		 221 aa  204  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  53.64 
 
 		 221 aa  204  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  54.55 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  53.18 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0321  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  55 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0380  heme ABC transporter (heme exporter protein B), permease protein (cytochrome c biogenesis)  55 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  53.81 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0410  heme exporter protein CcmB  54.55 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  56.76 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  50.23 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  50.45 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  50.45 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  48.87 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  53.64 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  49.77 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1412  heme exporter protein CcmB  60.27 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451001  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1179  heme exporter protein CcmB  56.56 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  48.87 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  48.87 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  48.87 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  48.87 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1000  heme exporter protein CcmB  57.01 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  46.61 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  48.86 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  47.96 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4189  heme exporter protein CcmB  53.49 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3085  heme exporter protein CcmB  52.53 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3507  heme exporter protein CcmB  57.31 
 
 		 239 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00483881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4063  heme exporter protein CcmB  52.56 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  49.32 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3740  heme exporter protein CcmB  53.02 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3359  heme exporter protein CcmB  52.15 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  48.64 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  47.96 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  48.86 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_004310  BR0095  heme exporter protein CcmB  52.07 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0093  heme exporter protein CcmB  52.07 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  50.68 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  49.48 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  51.61 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0107  heme exporter protein CcmB  52.63 
 
 		 221 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3854  heme exporter protein CcmB  53.74 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  49.09 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  50.67 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0448  heme exporter protein CcmB  55.44 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0460  heme exporter protein CcmB  55.44 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421512  normal  0.196055 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1802  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  54.92 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.813429  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  45.74 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  48.42 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  48.68 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  42.33 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  46.61 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  46.61 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  46.61 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  46.61 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  44.64 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  44.64 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  44.05 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  45.33 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  47.14 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  47.96 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  47.14 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  45.79 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  45.79 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  46.67 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  46.67 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  46.64 
 
 		 241 aa  141  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0214  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  44.64 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  44.89 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  45.25 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  45.25 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  45.25 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  45.25 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  45.25 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  45.25 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  45.25 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  45.25 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  45.25 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  50.27 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  48.42 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  45.91 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  52.49 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  47.26 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  46.61 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1285  heme exporter protein CcmB  37.5 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.583971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1644  heme exporter protein B  46.7 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1684  heme exporter protein CcmB  48.98 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  46.4 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4988  heme exporter protein CcmB  47.98 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1388  heme exporter protein CcmB  50.23 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0394  heme exporter protein B  50.23 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1497  heme exporter protein CcmB  50.23 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1854  heme exporter protein B  52.88 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116967  normal  0.847567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  43.89 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2648  heme exporter protein CcmB  59.63 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244767  normal  0.0118832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  52.3 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>