144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3392 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3392  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  100 
 
 		 223 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  87.89 
 
 		 223 aa  305  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1578  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  87.78 
 
 		 222 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45370  heme exporter protein CcmB  86.55 
 
 		 223 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30440  Cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  84.3 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2790  heme exporter protein CcmB  87.44 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4326  heme exporter protein CcmB  87.78 
 
 		 222 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3851  heme exporter protein CcmB  87 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3652  heme exporter protein CcmB  87.78 
 
 		 222 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3895  heme exporter protein CcmB  88.69 
 
 		 222 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0364758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1541  heme exporter protein CcmB  88.24 
 
 		 222 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  51.36 
 
 		 228 aa  204  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  52.27 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  51.82 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  51.82 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  51.82 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  51.82 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  51.6 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  51.36 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  51.36 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  51.36 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  51.82 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  50.46 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  52.97 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  54.93 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  51.82 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  55.96 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  51.6 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  52.73 
 
 		 219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  52.73 
 
 		 219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  52.49 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  50.91 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  51.58 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  51.58 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  49.02 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  50.47 
 
 		 231 aa  175  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  50.47 
 
 		 231 aa  175  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  52.04 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  52.04 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  52.04 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  52.04 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  50.24 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  51.58 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  51.58 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  45.7 
 
 		 239 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  49.5 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  50.23 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  55.45 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  55.24 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  55.24 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  55.24 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  55.24 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  55.24 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  55.24 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  55.24 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  55.24 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  55.24 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  52.83 
 
 		 222 aa  168  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  50 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  50.45 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  49.77 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  57.01 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1033  heme exporter protein CcmB  53.64 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1644  heme exporter protein B  52.94 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  49.55 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1388  heme exporter protein CcmB  56.68 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0394  heme exporter protein B  56.68 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1497  heme exporter protein CcmB  56.68 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1684  heme exporter protein CcmB  50 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  50.68 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  50 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  52.45 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  47.06 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  44.29 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  44.29 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  47.06 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  42.08 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  46.61 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  53.85 
 
 		 222 aa  148  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  45.21 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2423  heme exporter protein CcmB  56.54 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2727  heme exporter protein CcmB  56.07 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1561  heme exporter protein CcmB  50 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.195545  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  47.12 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  44.8 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  43.4 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1618  heme ABC transporter membrane protein  50.51 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0662313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  49.5 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0919  heme exporter protein CcmB  45.71 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0888  heme exporter protein CcmB  45.71 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0371  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  45.25 
 
 		 222 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000646849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1000  heme exporter protein CcmB  45.62 
 
 		 218 aa  137  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3414  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  41.78 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  45.32 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  47.62 
 
 		 222 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0947  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  52.49 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4767  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  49.53 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  44.81 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  44.81 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1412  heme exporter protein CcmB  48.97 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451001  normal  0.603742 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>