More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3554 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3554  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.433786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.25 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  42.35 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  42.35 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  40.8 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  42.46 
 
 		 254 aa  188  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 		 256 aa  187  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  40.56 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  42.52 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 256 aa  181  6e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  40.16 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  41.27 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  42.69 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  40.49 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  43.98 
 
 		 823 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  44.63 
 
 		 827 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  45.04 
 
 		 823 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.68 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  39.68 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  39.68 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  41.53 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  40.08 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  44.31 
 
 		 589 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  39.68 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3488  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  41.2 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  44.73 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  40.49 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  39.04 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  44.44 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  44 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  41.37 
 
 		 274 aa  175  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.76 
 
 		 258 aa  175  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  40.73 
 
 		 260 aa  174  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  42.97 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  39.2 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  40.16 
 
 		 258 aa  174  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  39.68 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  39.68 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  39.68 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  39.68 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  40.73 
 
 		 260 aa  174  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  40.56 
 
 		 257 aa  174  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 254 aa  174  9e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0565  ABC transporter related  41.27 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0274891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  42.04 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  38.46 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  40.87 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  41.18 
 
 		 624 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  38.15 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  40.16 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  39.53 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.46 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6452  ABC transporter related  42.02 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242945  hitchhiker  0.00000000013966 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  42.91 
 
 		 594 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  41.6 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4794  ABC transporter related  39.45 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130359  normal  0.133792 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  40.08 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  40.56 
 
 		 258 aa  171  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  40.16 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  39.76 
 
 		 255 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  44.35 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  38.71 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  42.92 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  38 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  43.51 
 
 		 822 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.4 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 254 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  38.13 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  37.9 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  36.61 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  40 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  37.04 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  40.4 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  38.89 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  39.76 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0478  ABC transporter related  44.05 
 
 		 634 aa  169  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  39.76 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  37.86 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  43.75 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  41.3 
 
 		 652 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.96 
 
 		 257 aa  168  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  40.98 
 
 		 262 aa  168  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>