99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0900 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  100 
 
 		 619 aa  1241    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  45.9 
 
 		 640 aa  535  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  41.01 
 
 		 636 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  41.51 
 
 		 492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.23 
 
 		 493 aa  326  9e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  41 
 
 		 495 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  41.54 
 
 		 492 aa  324  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 493 aa  322  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  42.92 
 
 		 487 aa  321  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  39.92 
 
 		 492 aa  320  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  40.89 
 
 		 492 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.72 
 
 		 487 aa  309  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  41.76 
 
 		 492 aa  309  8e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  42.24 
 
 		 489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  40.22 
 
 		 481 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  38.89 
 
 		 502 aa  300  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  39.06 
 
 		 496 aa  296  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  39.1 
 
 		 492 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  39.1 
 
 		 492 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  39.1 
 
 		 492 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  40.77 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.75 
 
 		 476 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.95 
 
 		 497 aa  286  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  38.28 
 
 		 498 aa  284  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  38.22 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  38.41 
 
 		 496 aa  274  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  38.27 
 
 		 491 aa  273  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  37.86 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  40.47 
 
 		 500 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  39.33 
 
 		 478 aa  266  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  41 
 
 		 477 aa  266  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  36.05 
 
 		 477 aa  264  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  35.63 
 
 		 477 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  34.8 
 
 		 479 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  37.17 
 
 		 503 aa  258  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  38.66 
 
 		 478 aa  256  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  36.63 
 
 		 502 aa  253  7e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  35.21 
 
 		 477 aa  251  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  33.06 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  28.51 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  30.24 
 
 		 571 aa  108  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  27.96 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  28.46 
 
 		 519 aa  94  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  28.94 
 
 		 517 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  28.94 
 
 		 514 aa  87.4  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  28.12 
 
 		 295 aa  54.7  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  27.78 
 
 		 143 aa  53.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  32.14 
 
 		 867 aa  52.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.31 
 
 		 489 aa  51.2  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  27.74 
 
 		 502 aa  50.4  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 139 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  29.29 
 
 		 148 aa  50.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  26.55 
 
 		 845 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 		 321 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 		 144 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 		 321 aa  49.3  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 140 aa  48.9  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  36.62 
 
 		 859 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  27.19 
 
 		 286 aa  47.8  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  28.8 
 
 		 282 aa  47.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  32.81 
 
 		 154 aa  47.4  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.25 
 
 		 633 aa  47.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  24.17 
 
 		 140 aa  47.8  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  30.51 
 
 		 202 aa  47.4  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 138 aa  47  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  29.2 
 
 		 286 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2996  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 150 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  30.95 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  26.27 
 
 		 147 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  26.56 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  32.76 
 
 		 287 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  33.94 
 
 		 142 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  28.07 
 
 		 286 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  31.93 
 
 		 139 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  26.89 
 
 		 309 aa  45.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  23.94 
 
 		 149 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.46 
 
 		 888 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.63 
 
 		 500 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  33.9 
 
 		 147 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  27.19 
 
 		 875 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  33.9 
 
 		 147 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2060  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.86 
 
 		 490 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  28.68 
 
 		 208 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  31.73 
 
 		 151 aa  44.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1837  CBS domain-containing protein  31.73 
 
 		 155 aa  44.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  29.6 
 
 		 142 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  30.77 
 
 		 155 aa  44.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  28.95 
 
 		 286 aa  44.7  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  24.79 
 
 		 189 aa  44.3  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  34.17 
 
 		 166 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  30.19 
 
 		 279 aa  44.3  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  22.99 
 
 		 500 aa  44.3  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  40 
 
 		 262 aa  44.3  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  27.73 
 
 		 124 aa  44.3  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  25.78 
 
 		 875 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.08 
 
 		 863 aa  43.9  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  27.2 
 
 		 142 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  34.48 
 
 		 503 aa  43.9  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  24.14 
 
 		 141 aa  43.9  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>