45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2305 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  969    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  52.09 
 
 		 487 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  46.85 
 
 		 481 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  39.42 
 
 		 479 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  44.35 
 
 		 477 aa  352  8.999999999999999e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  44.35 
 
 		 476 aa  352  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  40.42 
 
 		 494 aa  350  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  39.58 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  38.25 
 
 		 477 aa  331  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  38.46 
 
 		 477 aa  331  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  39.42 
 
 		 640 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  39.46 
 
 		 478 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 636 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  37.78 
 
 		 492 aa  267  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  39.33 
 
 		 619 aa  266  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  35.56 
 
 		 493 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.53 
 
 		 495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  37.25 
 
 		 492 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  35.29 
 
 		 492 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  35.35 
 
 		 492 aa  246  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  35.43 
 
 		 492 aa  246  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  35.5 
 
 		 492 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  36.4 
 
 		 496 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  35.5 
 
 		 492 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  35.5 
 
 		 492 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  38.94 
 
 		 489 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  35.4 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  35.02 
 
 		 502 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.39 
 
 		 493 aa  239  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  35.59 
 
 		 502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  34.71 
 
 		 503 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.52 
 
 		 497 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  36.3 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  34.96 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  33.67 
 
 		 495 aa  231  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  34.27 
 
 		 496 aa  226  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.4 
 
 		 487 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  33.46 
 
 		 502 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  35.8 
 
 		 500 aa  199  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  27.22 
 
 		 513 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  29.91 
 
 		 517 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  30.12 
 
 		 519 aa  95.5  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  25.89 
 
 		 571 aa  91.3  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  28.9 
 
 		 519 aa  90.9  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  28.25 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.435827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>