45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1325 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  86.5 
 
 
492 aa  887    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  75.71 
 
 
509 aa  759    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  1022    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  86.5 
 
 
492 aa  887    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  86.5 
 
 
492 aa  887    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  65.32 
 
 
492 aa  671    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  93.15 
 
 
496 aa  949    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  60.16 
 
 
492 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  60.28 
 
 
497 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  58.06 
 
 
492 aa  595  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  59.43 
 
 
493 aa  596  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  57.52 
 
 
498 aa  579  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  60.85 
 
 
492 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  61.26 
 
 
492 aa  571  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  60.13 
 
 
493 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  60.61 
 
 
489 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  58.13 
 
 
487 aa  555  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  56.13 
 
 
502 aa  551  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  56.52 
 
 
502 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  52.1 
 
 
502 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  51 
 
 
495 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  49.31 
 
 
503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  50 
 
 
500 aa  444  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  44.99 
 
 
491 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  36.29 
 
 
636 aa  320  5e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  37.37 
 
 
640 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  38.68 
 
 
487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  40.36 
 
 
478 aa  299  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  39.06 
 
 
619 aa  295  9e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  36.22 
 
 
481 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  35.31 
 
 
495 aa  290  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  35.07 
 
 
479 aa  277  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  37.63 
 
 
477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  36.42 
 
 
494 aa  267  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  35.6 
 
 
477 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  36.09 
 
 
477 aa  264  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  35.48 
 
 
477 aa  259  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  36.02 
 
 
476 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  36.4 
 
 
478 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  26.69 
 
 
519 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  28.13 
 
 
513 aa  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  27.88 
 
 
517 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  26.71 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  26.75 
 
 
514 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  27.81 
 
 
571 aa  97.8  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.491652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>