45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14920 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  1025    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  49.31 
 
 
492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  49.31 
 
 
492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  49.31 
 
 
492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  49.31 
 
 
496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  49.12 
 
 
498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  49.11 
 
 
492 aa  445  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  47.91 
 
 
493 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  48.61 
 
 
496 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  46.03 
 
 
492 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  47.13 
 
 
492 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.13 
 
 
497 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  47.4 
 
 
509 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.72 
 
 
493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  46.86 
 
 
502 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  46 
 
 
487 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  44.4 
 
 
502 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.74 
 
 
495 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  45.13 
 
 
492 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  46.32 
 
 
489 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  45.33 
 
 
492 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  44.34 
 
 
502 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  45.08 
 
 
500 aa  355  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  43.89 
 
 
491 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  34.07 
 
 
640 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  35.05 
 
 
479 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  39.09 
 
 
476 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  34.46 
 
 
495 aa  279  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  36.63 
 
 
477 aa  276  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  36.25 
 
 
481 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  36.88 
 
 
494 aa  273  7e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  36.76 
 
 
477 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  36.44 
 
 
487 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  36.24 
 
 
477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  31.74 
 
 
636 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  37.17 
 
 
619 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  36.58 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  34.71 
 
 
478 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  36.31 
 
 
477 aa  237  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  28.02 
 
 
517 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  27.61 
 
 
519 aa  124  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  27.82 
 
 
513 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  27.25 
 
 
519 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  26.01 
 
 
514 aa  95.9  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  28.61 
 
 
571 aa  94.4  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.491652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>