46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6279 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  100 
 
 		 478 aa  944    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  39.31 
 
 		 495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.5 
 
 		 495 aa  326  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  41.06 
 
 		 492 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  40.36 
 
 		 502 aa  316  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  40.85 
 
 		 492 aa  316  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  40.24 
 
 		 492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.26 
 
 		 493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  40.36 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  38.31 
 
 		 640 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  39.43 
 
 		 492 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  39.43 
 
 		 492 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  39.43 
 
 		 492 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.36 
 
 		 497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  39.84 
 
 		 492 aa  302  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  39.88 
 
 		 496 aa  296  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  39.28 
 
 		 498 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  38.38 
 
 		 492 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 		 493 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  40.65 
 
 		 491 aa  292  9e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  40.49 
 
 		 509 aa  289  6e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  38.27 
 
 		 487 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  37.7 
 
 		 481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.98 
 
 		 489 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  39.79 
 
 		 477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  39.46 
 
 		 478 aa  283  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  37.78 
 
 		 487 aa  276  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  33.94 
 
 		 636 aa  276  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.53 
 
 		 476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  38.66 
 
 		 619 aa  270  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  34.97 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  36.65 
 
 		 502 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  36.58 
 
 		 502 aa  260  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  36.78 
 
 		 503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  39.72 
 
 		 500 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  34.7 
 
 		 477 aa  250  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 477 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  34.35 
 
 		 494 aa  246  8e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  33.88 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  27.24 
 
 		 517 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  29.19 
 
 		 519 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  25.61 
 
 		 519 aa  99.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  26.25 
 
 		 514 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  26.94 
 
 		 513 aa  94  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  27.48 
 
 		 571 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.67 
 
 		 852 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>