45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3579 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1018    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  76.1 
 
 		 502 aa  774    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  64.74 
 
 		 497 aa  652    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  60.96 
 
 		 498 aa  618  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  60.83 
 
 		 493 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  60.56 
 
 		 492 aa  592  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  58.28 
 
 		 492 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  57.46 
 
 		 492 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  55.69 
 
 		 492 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  56.52 
 
 		 496 aa  569  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  55.69 
 
 		 492 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  55.69 
 
 		 492 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  56.92 
 
 		 496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  58.6 
 
 		 487 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  57.46 
 
 		 493 aa  552  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  60.4 
 
 		 489 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  54.78 
 
 		 509 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  56.06 
 
 		 492 aa  527  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  56.26 
 
 		 492 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  53.25 
 
 		 495 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  49.51 
 
 		 502 aa  458  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  46.86 
 
 		 503 aa  405  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  47.02 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  46.93 
 
 		 491 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  34.41 
 
 		 636 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  35.98 
 
 		 640 aa  299  8e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  35.64 
 
 		 481 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  33.47 
 
 		 495 aa  277  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  38.77 
 
 		 476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  36.63 
 
 		 619 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  32.81 
 
 		 479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  35.57 
 
 		 487 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  36.65 
 
 		 478 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  32.41 
 
 		 477 aa  256  8e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  32.61 
 
 		 494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  33.4 
 
 		 477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  32.87 
 
 		 477 aa  247  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  36.02 
 
 		 477 aa  246  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  33.46 
 
 		 478 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  28 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  26.48 
 
 		 517 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  25.34 
 
 		 519 aa  116  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  27 
 
 		 519 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  25.82 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  28.38 
 
 		 571 aa  99  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.491652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>