46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1017 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  100 
 
 		 476 aa  945    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  60.17 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  47.79 
 
 		 481 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  48.22 
 
 		 487 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  43.82 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  42.38 
 
 		 479 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  43.22 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  43.42 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  43.22 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  44.35 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  40.37 
 
 		 492 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  39.15 
 
 		 492 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  39.8 
 
 		 498 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.53 
 
 		 495 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  39.36 
 
 		 492 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.16 
 
 		 497 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  38.74 
 
 		 493 aa  313  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  37.21 
 
 		 640 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.07 
 
 		 493 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  37.9 
 
 		 502 aa  303  5.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  40.75 
 
 		 619 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  38.52 
 
 		 487 aa  302  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  39.35 
 
 		 492 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  37.14 
 
 		 492 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  37.14 
 
 		 492 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  37.14 
 
 		 492 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.29 
 
 		 489 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  40.57 
 
 		 492 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  39.09 
 
 		 503 aa  291  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  39.35 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  37.97 
 
 		 502 aa  283  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  32.45 
 
 		 636 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  36.99 
 
 		 509 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  40.53 
 
 		 478 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  36.02 
 
 		 496 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  36.96 
 
 		 502 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  38.27 
 
 		 496 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  39.16 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  32.25 
 
 		 495 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  29.16 
 
 		 513 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  30.36 
 
 		 571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  30.43 
 
 		 519 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  27.42 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  26.41 
 
 		 519 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  26.99 
 
 		 517 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 362 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>