45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0031 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  64.97 
 
 		 493 aa  646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  62.73 
 
 		 492 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  92.28 
 
 		 492 aa  881    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  1001    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  62.73 
 
 		 492 aa  630  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  63.62 
 
 		 493 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  62.17 
 
 		 492 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  62.17 
 
 		 492 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  62.17 
 
 		 492 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  60.85 
 
 		 496 aa  594  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  60.69 
 
 		 492 aa  591  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  61.96 
 
 		 487 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  61.87 
 
 		 496 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  59.51 
 
 		 509 aa  565  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  56.43 
 
 		 502 aa  565  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  62.24 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  57.31 
 
 		 498 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  57.43 
 
 		 497 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  55.26 
 
 		 495 aa  539  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  56.06 
 
 		 502 aa  529  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  55.67 
 
 		 502 aa  520  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  47.15 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  48.89 
 
 		 500 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  45.13 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  38.8 
 
 		 636 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  41.31 
 
 		 619 aa  323  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  39.27 
 
 		 487 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  41.06 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  36.16 
 
 		 495 aa  311  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  37.01 
 
 		 640 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  39.15 
 
 		 476 aa  302  9e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  35.89 
 
 		 494 aa  294  3e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  40.24 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  35.01 
 
 		 479 aa  287  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  34.07 
 
 		 481 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  36.62 
 
 		 477 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  36.42 
 
 		 477 aa  282  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  35.61 
 
 		 477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  36.11 
 
 		 478 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  27.86 
 
 		 571 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  26.84 
 
 		 514 aa  105  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  24.85 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  26.21 
 
 		 513 aa  93.6  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  25 
 
 		 517 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  26.25 
 
 		 519 aa  91.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>