51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0560 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  995    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  51.78 
 
 		 481 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  52.09 
 
 		 478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  48.85 
 
 		 477 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  48.64 
 
 		 477 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  48.85 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  47.81 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  45.51 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  48.22 
 
 		 476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  49.89 
 
 		 477 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.44 
 
 		 495 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  39.6 
 
 		 492 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  42.92 
 
 		 619 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  39.36 
 
 		 492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  41.36 
 
 		 492 aa  316  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  41.58 
 
 		 492 aa  310  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  39.6 
 
 		 492 aa  309  6.999999999999999e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  37.65 
 
 		 492 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  37.65 
 
 		 492 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  37.65 
 
 		 492 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  38.68 
 
 		 496 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  37.55 
 
 		 640 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  38.31 
 
 		 509 aa  296  7e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  34.83 
 
 		 636 aa  293  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.47 
 
 		 493 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  37.68 
 
 		 496 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  37.42 
 
 		 487 aa  286  9e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  38.27 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  37.73 
 
 		 489 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  36.07 
 
 		 498 aa  276  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.2 
 
 		 497 aa  276  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  35.87 
 
 		 502 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  36.44 
 
 		 503 aa  263  4.999999999999999e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  36.77 
 
 		 491 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.98 
 
 		 502 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  34.78 
 
 		 502 aa  242  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  33.26 
 
 		 495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  38.77 
 
 		 500 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  27.22 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  26.64 
 
 		 517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  27.47 
 
 		 513 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  28.03 
 
 		 514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  28.04 
 
 		 519 aa  111  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  28.16 
 
 		 571 aa  96.7  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  25.75 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  25.75 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  25.52 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  24.84 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  28.46 
 
 		 387 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  25.57 
 
 		 380 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>