45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1380 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  100 
 
 
571 aa  1146    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  53.41 
 
 
513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  39.64 
 
 
519 aa  298  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  39.29 
 
 
517 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  38.98 
 
 
514 aa  281  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  38.14 
 
 
519 aa  272  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  29.28 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  27.71 
 
 
493 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  27.96 
 
 
502 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  26.28 
 
 
479 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  27.86 
 
 
492 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  30.24 
 
 
619 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.86 
 
 
497 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  26.43 
 
 
492 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.79 
 
 
487 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  25.06 
 
 
636 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  29.56 
 
 
477 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  26.16 
 
 
492 aa  102  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  29.85 
 
 
498 aa  100  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  27.62 
 
 
492 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  31.56 
 
 
500 aa  99.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  28 
 
 
493 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  29.15 
 
 
492 aa  98.2  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  27.81 
 
 
496 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  28.16 
 
 
487 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  28.94 
 
 
502 aa  96.3  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.22 
 
 
476 aa  94.4  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  28.61 
 
 
503 aa  94  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  26.89 
 
 
502 aa  93.6  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  26.71 
 
 
640 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  25.89 
 
 
478 aa  91.3  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  26.67 
 
 
492 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  26.67 
 
 
492 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  26.67 
 
 
492 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  27.47 
 
 
477 aa  87  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.16 
 
 
495 aa  87  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  31.71 
 
 
509 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  27.55 
 
 
477 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  27.23 
 
 
489 aa  84.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  28.33 
 
 
477 aa  84  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  27.78 
 
 
496 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  29.22 
 
 
491 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  25.07 
 
 
495 aa  83.6  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  29.45 
 
 
478 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  24.63 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>