45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1008 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1048    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  59.66 
 
 
519 aa  621  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  60.08 
 
 
517 aa  611  9.999999999999999e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  57.17 
 
 
519 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  38.52 
 
 
513 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  38.98 
 
 
571 aa  281  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  26.25 
 
 
492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  26.25 
 
 
492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  26.25 
 
 
492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  27.82 
 
 
487 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  29.39 
 
 
481 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  28.02 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  26.44 
 
 
477 aa  110  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  26.75 
 
 
496 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  25.79 
 
 
477 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  26.57 
 
 
491 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.93 
 
 
497 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  25.81 
 
 
636 aa  107  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  26.1 
 
 
498 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  26.67 
 
 
509 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  26.84 
 
 
492 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  25.97 
 
 
487 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  25.36 
 
 
477 aa  104  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  25.82 
 
 
502 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  29.36 
 
 
477 aa  97.4  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.4 
 
 
493 aa  97.4  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  26.43 
 
 
492 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.59 
 
 
495 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  24.89 
 
 
479 aa  96.3  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  25.68 
 
 
492 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  26.06 
 
 
503 aa  94.4  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  26.86 
 
 
492 aa  94  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  26.62 
 
 
492 aa  93.6  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  26.49 
 
 
489 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  25.62 
 
 
496 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  24.8 
 
 
502 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  28.86 
 
 
640 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  26.13 
 
 
478 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  27.34 
 
 
476 aa  89.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  24.32 
 
 
494 aa  87.8  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  28.94 
 
 
619 aa  87.8  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  25.77 
 
 
502 aa  87.8  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  28.31 
 
 
500 aa  87  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  24.64 
 
 
495 aa  83.6  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  28.25 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>