45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1230 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  64.93 
 
 		 479 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  86.79 
 
 		 477 aa  883    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  985    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  89.31 
 
 		 477 aa  897    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  59.71 
 
 		 494 aa  600  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  48.85 
 
 		 487 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  48.23 
 
 		 481 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  43.42 
 
 		 476 aa  362  6e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  39.58 
 
 		 478 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  42.08 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.28 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  38.31 
 
 		 492 aa  286  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  36.57 
 
 		 492 aa  286  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  36.69 
 
 		 492 aa  286  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.44 
 
 		 497 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  35.69 
 
 		 493 aa  279  9e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  34.78 
 
 		 640 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  36.62 
 
 		 492 aa  275  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  36.63 
 
 		 503 aa  274  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  35.63 
 
 		 492 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  35.63 
 
 		 492 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  35.63 
 
 		 492 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  33.4 
 
 		 636 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  36.06 
 
 		 498 aa  269  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  36.71 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  36.42 
 
 		 492 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  36.09 
 
 		 496 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  35.29 
 
 		 509 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  35.63 
 
 		 619 aa  262  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.22 
 
 		 493 aa  259  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  34.92 
 
 		 502 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  35.73 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.22 
 
 		 487 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  33.4 
 
 		 502 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  34.29 
 
 		 478 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  32.86 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.02 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  31.21 
 
 		 495 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  36 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  25.83 
 
 		 517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  24.95 
 
 		 519 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  23.22 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  26 
 
 		 519 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  26.24 
 
 		 514 aa  106  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  27.55 
 
 		 571 aa  86.7  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.491652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>