45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0877 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  1050    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  59.77 
 
 
517 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  59.5 
 
 
519 aa  593  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  57.17 
 
 
514 aa  556  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  37.57 
 
 
513 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  38.57 
 
 
571 aa  272  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  29.52 
 
 
492 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  29.52 
 
 
492 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  29.52 
 
 
492 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  26.69 
 
 
496 aa  126  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  25.35 
 
 
481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  27.29 
 
 
477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  27.31 
 
 
477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  28.86 
 
 
492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  29.68 
 
 
509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  28.04 
 
 
487 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  26.77 
 
 
492 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  27.04 
 
 
492 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  26.61 
 
 
498 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  26.73 
 
 
496 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  26 
 
 
477 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  28.71 
 
 
493 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  28.8 
 
 
503 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  25.74 
 
 
479 aa  104  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  24.71 
 
 
494 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.83 
 
 
497 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  26.02 
 
 
636 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  29.19 
 
 
478 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  26.53 
 
 
502 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  27.57 
 
 
489 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  25.45 
 
 
502 aa  97.8  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.64 
 
 
495 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  30.12 
 
 
478 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  25.41 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  28.46 
 
 
619 aa  94  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.63 
 
 
476 aa  93.6  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  28.31 
 
 
640 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  26.25 
 
 
492 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  26.25 
 
 
477 aa  91.3  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  25.85 
 
 
502 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  24.42 
 
 
491 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  26.84 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  27.81 
 
 
500 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.77 
 
 
493 aa  80.9  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  27.87 
 
 
495 aa  76.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>