45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13729 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  78.73 
 
 
492 aa  803    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1051    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  78.73 
 
 
492 aa  803    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  63.88 
 
 
492 aa  646    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  77.35 
 
 
496 aa  775    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  75.71 
 
 
496 aa  778    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  78.73 
 
 
492 aa  803    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  60.33 
 
 
492 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  58.69 
 
 
493 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  57.87 
 
 
492 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  57.95 
 
 
497 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  59.51 
 
 
492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  55.15 
 
 
498 aa  549  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  59.3 
 
 
492 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  59.84 
 
 
489 aa  545  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  56.35 
 
 
487 aa  537  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  57.87 
 
 
493 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  54.09 
 
 
502 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  54.78 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  51.52 
 
 
502 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  51.82 
 
 
495 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  48.48 
 
 
500 aa  420  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  47.4 
 
 
503 aa  418  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  44.99 
 
 
491 aa  395  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  37.68 
 
 
640 aa  319  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  40.77 
 
 
619 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  33.27 
 
 
636 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  38.31 
 
 
487 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  40.29 
 
 
478 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  35.96 
 
 
481 aa  292  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  34.62 
 
 
495 aa  286  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  35.09 
 
 
479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  36.99 
 
 
476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  35.29 
 
 
477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  35.01 
 
 
477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  35.73 
 
 
494 aa  272  8.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  37.45 
 
 
477 aa  267  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  34.82 
 
 
477 aa  266  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  34.96 
 
 
478 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  29.33 
 
 
513 aa  127  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  27.76 
 
 
519 aa  124  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  29.68 
 
 
519 aa  123  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  26.67 
 
 
514 aa  120  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  28.32 
 
 
517 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  31.71 
 
 
571 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.491652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>