45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4753 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  64.56 
 
 
492 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  70.61 
 
 
489 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 
493 aa  1001    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  64.15 
 
 
492 aa  646    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  64.36 
 
 
493 aa  646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  63.62 
 
 
492 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  60.94 
 
 
492 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  60.94 
 
 
492 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  60.94 
 
 
492 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  61.96 
 
 
487 aa  601  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  63.21 
 
 
492 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  59.64 
 
 
497 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  59.88 
 
 
492 aa  590  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  58.4 
 
 
498 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  58.62 
 
 
496 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  59.43 
 
 
496 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  57.26 
 
 
502 aa  550  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  57.87 
 
 
509 aa  550  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  55.47 
 
 
502 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  54.86 
 
 
495 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  52.41 
 
 
502 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  47.72 
 
 
503 aa  421  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  48.94 
 
 
500 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  46.45 
 
 
491 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  38.95 
 
 
636 aa  350  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  40.67 
 
 
640 aa  340  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  44.07 
 
 
619 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  35.89 
 
 
495 aa  311  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  41.26 
 
 
478 aa  309  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  38.26 
 
 
487 aa  302  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  36.44 
 
 
481 aa  299  6e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  39.07 
 
 
476 aa  298  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  36.42 
 
 
479 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  38.91 
 
 
477 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  35.28 
 
 
494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  36.22 
 
 
477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  35.61 
 
 
477 aa  268  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  36.14 
 
 
477 aa  268  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  36.09 
 
 
478 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  28 
 
 
571 aa  104  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  26.69 
 
 
513 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  26.5 
 
 
514 aa  100  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  25.84 
 
 
517 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  24.71 
 
 
519 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  26.14 
 
 
519 aa  84.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>