45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2290 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  67.89 
 
 		 487 aa  668    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  68.64 
 
 		 493 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  998    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  89.02 
 
 		 492 aa  899    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  61.99 
 
 		 492 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  61.99 
 
 		 492 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  61.99 
 
 		 492 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  64.43 
 
 		 489 aa  629  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  64.56 
 
 		 493 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  60.16 
 
 		 496 aa  620  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  62.73 
 
 		 492 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  61.29 
 
 		 496 aa  614  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  63.34 
 
 		 492 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  59.96 
 
 		 492 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  58.87 
 
 		 497 aa  592  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  60.33 
 
 		 509 aa  594  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  56.02 
 
 		 498 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  56.48 
 
 		 495 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  58.28 
 
 		 502 aa  558  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  56.26 
 
 		 502 aa  549  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  52.42 
 
 		 502 aa  518  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  46.34 
 
 		 491 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  46.03 
 
 		 503 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  47.48 
 
 		 500 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  39.6 
 
 		 487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  35.35 
 
 		 636 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  39.92 
 
 		 619 aa  319  9e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  36.55 
 
 		 640 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  39.15 
 
 		 476 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  35.69 
 
 		 495 aa  306  7e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  40.24 
 
 		 478 aa  302  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  36.92 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  36.49 
 
 		 479 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  36.69 
 
 		 477 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  36.9 
 
 		 494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  37.85 
 
 		 477 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  35.28 
 
 		 477 aa  276  9e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  35.08 
 
 		 477 aa  270  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  35.35 
 
 		 478 aa  246  6e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  26.77 
 
 		 519 aa  111  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  26.43 
 
 		 571 aa  106  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  24.86 
 
 		 513 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  26.43 
 
 		 514 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  25.57 
 
 		 519 aa  95.9  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  26.04 
 
 		 517 aa  94.7  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>