201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4858 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4858  Malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
333 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.169234 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4818  Malate/L-lactate dehydrogenase  51.4 
 
 
334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.949996  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  32.4 
 
 
344 aa  150  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  37.6 
 
 
339 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  38.22 
 
 
329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.5 
 
 
329 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  30.92 
 
 
340 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  33.04 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  28.31 
 
 
340 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2141  malate/L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437506  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  30.39 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  30.39 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  28.18 
 
 
340 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  31.97 
 
 
341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5101  malate/L-lactate dehydrogenase  34.31 
 
 
331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.540647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  31.97 
 
 
332 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.51 
 
 
356 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  32.14 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  29.93 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  34.28 
 
 
350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.92 
 
 
350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  29.93 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  30.26 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.97 
 
 
333 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.21 
 
 
338 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  29.61 
 
 
344 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  29.61 
 
 
344 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  29.28 
 
 
344 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  29.61 
 
 
344 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  30.69 
 
 
334 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  29.28 
 
 
344 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  31.05 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  31.05 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  31.05 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2116  malate/L-lactate dehydrogenase  32.92 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  30.19 
 
 
346 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.77 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  33.68 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  32.26 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  31.56 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  31.38 
 
 
349 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  30.11 
 
 
343 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  30.82 
 
 
343 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  31.45 
 
 
356 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  27.69 
 
 
336 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  31.79 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  30.24 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  31.84 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  29.75 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  28.51 
 
 
336 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  31.82 
 
 
337 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.36 
 
 
332 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54834  dehydrogenase  38.12 
 
 
392 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286619  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  32.16 
 
 
348 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  31.22 
 
 
349 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  30.73 
 
 
349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  30.73 
 
 
349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  30.73 
 
 
349 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  32.3 
 
 
351 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.27 
 
 
350 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.21 
 
 
732 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3323  malate/L-lactate dehydrogenase  26.78 
 
 
348 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.115763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.38 
 
 
349 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  30 
 
 
349 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.38 
 
 
349 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.15 
 
 
355 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  27.37 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  27.37 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.7 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  28.79 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  30.47 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  27.37 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  28.11 
 
 
343 aa  97.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.05 
 
 
360 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  27.37 
 
 
349 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  27.37 
 
 
349 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  31.28 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  27.37 
 
 
349 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  30.63 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.57 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.28 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  38.16 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  30.13 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6385  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.29 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.738936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.79 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  27.01 
 
 
349 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.2 
 
 
353 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  34.5 
 
 
349 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  39.13 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  31.19 
 
 
347 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  34.98 
 
 
352 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  31.19 
 
 
347 aa  93.2  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  28.9 
 
 
345 aa  93.6  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  30.8 
 
 
375 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.35 
 
 
355 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  29.49 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  31.42 
 
 
349 aa  89.4  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  25.73 
 
 
376 aa  89.4  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  25.54 
 
 
383 aa  89  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  30.28 
 
 
347 aa  89.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>