201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6359 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
349 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  88.63 
 
 
352 aa  608  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3802  malate/L-lactate dehydrogenase  64.18 
 
 
343 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.35 
 
 
332 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.82 
 
 
349 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.86 
 
 
331 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.01 
 
 
353 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  33.93 
 
 
348 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.55 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36.74 
 
 
339 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  34.49 
 
 
343 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.53 
 
 
383 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 
343 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.35 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  30.34 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  38.86 
 
 
349 aa  145  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.64 
 
 
329 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  36.97 
 
 
349 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.23 
 
 
355 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.55 
 
 
349 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.55 
 
 
349 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6385  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
344 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.738936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  35.42 
 
 
344 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  41.63 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  31.27 
 
 
336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  32.31 
 
 
345 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.09 
 
 
359 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  34.06 
 
 
344 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  29.15 
 
 
361 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  33.02 
 
 
340 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  32.84 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3870  malate/L-lactate dehydrogenase  34.06 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  31.38 
 
 
337 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.94 
 
 
353 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.21 
 
 
361 aa  135  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  33.13 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  32.71 
 
 
340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  32.71 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  32.71 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  32.71 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  33.53 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  32.51 
 
 
340 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.93 
 
 
360 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  30.7 
 
 
336 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  33.23 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3323  malate/L-lactate dehydrogenase  32.62 
 
 
348 aa  132  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.115763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  29.49 
 
 
351 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  32.82 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  32.4 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  32.4 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  29.88 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  32.09 
 
 
344 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  32.09 
 
 
344 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  32.09 
 
 
344 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  30.72 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  30.72 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  30.72 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.3 
 
 
357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0219  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  33.13 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.99 
 
 
732 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  26.74 
 
 
358 aa  126  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  31.33 
 
 
351 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  32.51 
 
 
356 aa  126  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.4 
 
 
334 aa  125  8.000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  29.43 
 
 
362 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  28.95 
 
 
365 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.35 
 
 
364 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.61 
 
 
353 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  34.48 
 
 
341 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  29.38 
 
 
337 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.98 
 
 
350 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  26.52 
 
 
376 aa  122  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2393  malate/L-lactate dehydrogenase  31.17 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  27.97 
 
 
361 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  28.45 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  30.51 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  31.12 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  34.17 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.72 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  29.33 
 
 
345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  25.64 
 
 
381 aa  119  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  27.38 
 
 
349 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 
341 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  26.09 
 
 
347 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  31.71 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  27.41 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  27.41 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  27.22 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  27.41 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  27.41 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  27.08 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  27.41 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  33.02 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  27.38 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  27.08 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  27.41 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  31.71 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  27.41 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.15 
 
 
362 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  27.41 
 
 
349 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>