202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1356 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 353 aa  720    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  37.25 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  37.5 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  37.21 
 
 		 361 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  37.5 
 
 		 361 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  37.21 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.21 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  37.21 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  37.21 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  37.21 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  36.15 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  34.62 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1601  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.21 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1632  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.69 
 
 		 353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000326891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  35.06 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  33.43 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  34.86 
 
 		 367 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  33.7 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  34.79 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.66 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.1 
 
 		 362 aa  192  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  35.63 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  33.7 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1798  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.82 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  34.17 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.15 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  34.93 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.32 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 350 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.43 
 
 		 353 aa  182  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1300  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.4 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  33.53 
 
 		 369 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  33.53 
 
 		 369 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.7 
 
 		 361 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  32.69 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  34.45 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  32.93 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  31.9 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  30.45 
 
 		 369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  32.34 
 
 		 369 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  32.34 
 
 		 369 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.87 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1845  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.85 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.957462  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  30.03 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  32.86 
 
 		 364 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  31.55 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3965  malate/L-lactate dehydrogenase  30.7 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  29.71 
 
 		 375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2132  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.99 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  32.63 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3972  malate/L-lactate dehydrogenase  32.16 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.901224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.74 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  29.26 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4538  malate/L-lactate dehydrogenase  31.78 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  33.52 
 
 		 348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.66 
 
 		 349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2393  malate/L-lactate dehydrogenase  31.01 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.05 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5343  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.34 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  28.9 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.45 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  30.52 
 
 		 361 aa  156  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.43 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.59 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.19 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  29.14 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.07 
 
 		 732 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  29.12 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5412  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.49 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.584123  hitchhiker  0.00277603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2575  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.18 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  31.8 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1530  hypothetical protein  32.17 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.11 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  31.16 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  31.16 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.08 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  31.16 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1752  malate/L-lactate dehydrogenase  32.74 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516121  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.59 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  29.76 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  28.74 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.48 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.29 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  28.9 
 
 		 362 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.53 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0106  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.1 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  31.45 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2854  malate/L-lactate dehydrogenase  30.87 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.803203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.46 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  34.39 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3548  malate/L-lactate dehydrogenase  29.46 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0039901  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  30.31 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2835  Ldh family oxidoreductase  30.55 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129302  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2947  malate/L-lactate dehydrogenase  30.97 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.353737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  29.01 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.8 
 
 		 338 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  28.49 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  27.99 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  30.59 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0042  malate/L-lactate dehydrogenase  27.19 
 
 		 349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>