202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3898 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
360 aa  692    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  49.85 
 
 
350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  43.75 
 
 
336 aa  232  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.73 
 
 
353 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  37.96 
 
 
361 aa  223  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  39.7 
 
 
365 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  40.25 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  38.21 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  42.09 
 
 
351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.03 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.61 
 
 
383 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  37.54 
 
 
349 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  33.93 
 
 
351 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  38.41 
 
 
349 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.54 
 
 
349 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.54 
 
 
349 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  37.74 
 
 
349 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  37.74 
 
 
349 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  37.42 
 
 
349 aa  186  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  37.35 
 
 
348 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  37.42 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  37.11 
 
 
349 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  35.85 
 
 
349 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  37.42 
 
 
349 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  35.85 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.14 
 
 
364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  35.53 
 
 
349 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  34.62 
 
 
351 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  35.53 
 
 
349 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  37.11 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  37.11 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.89 
 
 
732 aa  179  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  39.7 
 
 
348 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  31.96 
 
 
345 aa  176  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  39.2 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.14 
 
 
372 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  30.79 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  37.27 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.33 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  30.5 
 
 
347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  30.5 
 
 
347 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1446  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.36 
 
 
377 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0751418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.78 
 
 
364 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  28.99 
 
 
369 aa  159  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  31.9 
 
 
368 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.01 
 
 
355 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.03 
 
 
336 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.46 
 
 
367 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.71 
 
 
329 aa  155  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  31.63 
 
 
343 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  36.13 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  36.13 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  34.86 
 
 
340 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  31.81 
 
 
381 aa  153  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  28.93 
 
 
358 aa  153  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.75 
 
 
334 aa  153  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  36.13 
 
 
340 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  27.96 
 
 
376 aa  152  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.2 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  34.98 
 
 
340 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  33.01 
 
 
335 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  33.01 
 
 
335 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.26 
 
 
361 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  33.01 
 
 
335 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36.36 
 
 
339 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  33.77 
 
 
334 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  31.4 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  34.28 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  35.26 
 
 
337 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.86 
 
 
357 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.14 
 
 
359 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  37 
 
 
356 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  31.48 
 
 
337 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3802  malate/L-lactate dehydrogenase  38.56 
 
 
343 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  31.45 
 
 
361 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  31.45 
 
 
361 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.45 
 
 
361 aa  143  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  31.45 
 
 
361 aa  143  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4538  malate/L-lactate dehydrogenase  34.17 
 
 
354 aa  143  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  31.45 
 
 
361 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  31.45 
 
 
361 aa  143  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  30.97 
 
 
362 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  35.71 
 
 
344 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  31.45 
 
 
361 aa  142  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  32.73 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3548  malate/L-lactate dehydrogenase  33.82 
 
 
358 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0039901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  32.52 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  31.45 
 
 
361 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.69 
 
 
344 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  31.45 
 
 
361 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  34.31 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  38.17 
 
 
352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  30.52 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  32.74 
 
 
367 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  31.67 
 
 
343 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  33.98 
 
 
361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  32.16 
 
 
343 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  34.39 
 
 
369 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  32.56 
 
 
350 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.656536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>