202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0385 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  93.66 
 
 
347 aa  656    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  95.97 
 
 
347 aa  671    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
347 aa  694    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  84.01 
 
 
345 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  66.08 
 
 
345 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.82 
 
 
353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.81 
 
 
353 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  34.38 
 
 
361 aa  203  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.26 
 
 
364 aa  204  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.56 
 
 
344 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.73 
 
 
372 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  34.32 
 
 
336 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.93 
 
 
349 aa  192  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.37 
 
 
355 aa  188  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  34 
 
 
351 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  31.74 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  31.94 
 
 
348 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.04 
 
 
383 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  34.8 
 
 
381 aa  179  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  30.57 
 
 
376 aa  179  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 
367 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  32.26 
 
 
351 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
361 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.68 
 
 
359 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.93 
 
 
364 aa  175  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.01 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  32.39 
 
 
369 aa  172  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.44 
 
 
334 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  32.66 
 
 
365 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  33.04 
 
 
335 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  33.04 
 
 
335 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  33.04 
 
 
335 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.49 
 
 
345 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  31.64 
 
 
334 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  31.93 
 
 
349 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  32.23 
 
 
349 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  33.54 
 
 
351 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  31.93 
 
 
349 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  31.93 
 
 
349 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  27.46 
 
 
364 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  32.45 
 
 
328 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  28.28 
 
 
364 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  32.74 
 
 
362 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  29.82 
 
 
349 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  30.12 
 
 
349 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  32.19 
 
 
362 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2457  malate/L-lactate dehydrogenase  36.79 
 
 
356 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  29.82 
 
 
349 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  29.82 
 
 
349 aa  159  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  30.12 
 
 
349 aa  159  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  30.12 
 
 
349 aa  159  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  30.12 
 
 
349 aa  159  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  30.12 
 
 
349 aa  159  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0106  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.68 
 
 
346 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0971738  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  31.02 
 
 
368 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.5 
 
 
360 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0576  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.01 
 
 
337 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.939938  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  32.44 
 
 
361 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  32.14 
 
 
375 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  32.44 
 
 
361 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  32.44 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.44 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  32.44 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  32.44 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  32.14 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  32.44 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  32.44 
 
 
361 aa  155  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  29.55 
 
 
333 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  29.21 
 
 
358 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.19 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.77 
 
 
356 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.86 
 
 
349 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.86 
 
 
349 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.94 
 
 
355 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  32.18 
 
 
349 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  30.99 
 
 
361 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.5 
 
 
732 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  30.84 
 
 
367 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.43 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.01 
 
 
332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  30.21 
 
 
336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3293  malate/L-lactate dehydrogenase  28.31 
 
 
360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1597  2,3-diketo-L-gulonate reductase  30.25 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  29.6 
 
 
349 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.16 
 
 
353 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  29.5 
 
 
348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  28.45 
 
 
364 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  30 
 
 
355 aa  143  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  31.75 
 
 
344 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  34.1 
 
 
339 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  30.09 
 
 
341 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2132  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.18 
 
 
355 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  29.73 
 
 
332 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  29.43 
 
 
341 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.36 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0759  2,3-diketo-L-gulonate reductase  31.37 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54834  dehydrogenase  34.3 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286619  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  29.45 
 
 
353 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.46 
 
 
361 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0135  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.63 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>