203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3243 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  100 
 
 
335 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  100 
 
 
335 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  100 
 
 
335 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  78.68 
 
 
336 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.65 
 
 
334 aa  263  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  40.91 
 
 
349 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  40.91 
 
 
349 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  40.61 
 
 
349 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  40.61 
 
 
349 aa  259  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  40.91 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  40.91 
 
 
349 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  40.91 
 
 
349 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  40.3 
 
 
349 aa  258  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  39.7 
 
 
349 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  39.7 
 
 
349 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  39.39 
 
 
349 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  39.39 
 
 
349 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  37.42 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  35.54 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  33.64 
 
 
351 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.08 
 
 
349 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.43 
 
 
353 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  33.96 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  33.85 
 
 
361 aa  189  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  34.47 
 
 
349 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.16 
 
 
349 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.16 
 
 
349 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  35.01 
 
 
348 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2457  malate/L-lactate dehydrogenase  34.82 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.04 
 
 
364 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  35.13 
 
 
356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  33.02 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 
349 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 
732 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 
353 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  33.04 
 
 
347 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.96 
 
 
364 aa  169  9e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  32.62 
 
 
375 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  30.66 
 
 
356 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  31.6 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  33.98 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.46 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  31.12 
 
 
337 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.08 
 
 
345 aa  166  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  32.45 
 
 
347 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  30.75 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.21 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  32.74 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3257  hypothetical protein  32.32 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal  0.244853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  32.35 
 
 
332 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  30.95 
 
 
341 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  33.55 
 
 
351 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  31.95 
 
 
343 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.99 
 
 
355 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  31 
 
 
343 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.53 
 
 
350 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0106  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  30.54 
 
 
346 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0971738  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.21 
 
 
361 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  29.45 
 
 
358 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  31.35 
 
 
350 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  31.65 
 
 
349 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.86 
 
 
378 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  29.34 
 
 
366 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.35 
 
 
350 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.37 
 
 
383 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.83 
 
 
361 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.66 
 
 
331 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  32.12 
 
 
381 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  31.19 
 
 
341 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  28.53 
 
 
358 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  28.37 
 
 
361 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  31.73 
 
 
333 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  31.94 
 
 
334 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  30.12 
 
 
365 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  28.05 
 
 
361 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  31.12 
 
 
334 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  29.97 
 
 
340 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.27 
 
 
357 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.49 
 
 
356 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  29.97 
 
 
340 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  32.86 
 
 
343 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.46 
 
 
338 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  30.09 
 
 
362 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  27.78 
 
 
369 aa  145  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  34.88 
 
 
344 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  29.31 
 
 
368 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  28.33 
 
 
361 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.7 
 
 
344 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 
360 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  28.61 
 
 
367 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.87 
 
 
359 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  31.48 
 
 
329 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  34.82 
 
 
340 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  33.46 
 
 
345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  33.8 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  33.8 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3293  malate/L-lactate dehydrogenase  30.89 
 
 
360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769651  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  33.8 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  32.51 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>