202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1898 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
340 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  93.82 
 
 
340 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  95.29 
 
 
340 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  95 
 
 
340 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  95.29 
 
 
340 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  94.71 
 
 
340 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  93.99 
 
 
340 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  85.63 
 
 
344 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  85.33 
 
 
344 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  85.03 
 
 
344 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  85.03 
 
 
344 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  85.03 
 
 
344 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  85.03 
 
 
344 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  84.52 
 
 
346 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  65.56 
 
 
336 aa  457  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  58.86 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  58.86 
 
 
334 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  55.32 
 
 
337 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3323  malate/L-lactate dehydrogenase  51.79 
 
 
348 aa  363  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.115763 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  52.11 
 
 
345 aa  349  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3870  malate/L-lactate dehydrogenase  53.29 
 
 
345 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  52.94 
 
 
343 aa  340  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6385  Malate/L-lactate dehydrogenase  51.03 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.738936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  50.45 
 
 
344 aa  325  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  49.85 
 
 
343 aa  325  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  47.04 
 
 
356 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0219  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  46.69 
 
 
319 aa  293  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  42.04 
 
 
343 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  41.87 
 
 
343 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  40.99 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  41.47 
 
 
341 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  41.39 
 
 
332 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  40.59 
 
 
341 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  40.72 
 
 
341 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  39.88 
 
 
350 aa  226  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.6 
 
 
350 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2116  malate/L-lactate dehydrogenase  38.66 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  40.74 
 
 
349 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  38.1 
 
 
338 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.81 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  39.09 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  34.4 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  37.2 
 
 
333 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36.2 
 
 
339 aa  186  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.02 
 
 
333 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.26 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  35.44 
 
 
337 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.54 
 
 
353 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5101  malate/L-lactate dehydrogenase  35.08 
 
 
331 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.540647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  31.95 
 
 
336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2141  malate/L-lactate dehydrogenase  31.94 
 
 
328 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437506  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.29 
 
 
332 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  32.84 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.8 
 
 
360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  34.29 
 
 
351 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.53 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  33.8 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  33.8 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  33.8 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  35.45 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.62 
 
 
355 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.29 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4858  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.92 
 
 
333 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.169234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  32.19 
 
 
352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  32.64 
 
 
369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  29.21 
 
 
361 aa  133  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.97 
 
 
345 aa  133  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.74 
 
 
344 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  31.67 
 
 
351 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.45 
 
 
353 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.27 
 
 
732 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  32.29 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  32.29 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  32.29 
 
 
369 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  31.8 
 
 
348 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  34.01 
 
 
349 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  32.3 
 
 
361 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  31.94 
 
 
369 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  35.56 
 
 
364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  31.69 
 
 
361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  31.82 
 
 
361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  31.47 
 
 
361 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  31.47 
 
 
361 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0746 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.47 
 
 
361 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  31.47 
 
 
361 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  31.69 
 
 
361 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  31.47 
 
 
361 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  31.69 
 
 
361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  30.77 
 
 
362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  29.6 
 
 
356 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  34.83 
 
 
349 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.83 
 
 
349 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.83 
 
 
349 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  33.2 
 
 
369 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  34.1 
 
 
364 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.18 
 
 
364 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  27.63 
 
 
349 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  27.63 
 
 
349 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  29.27 
 
 
345 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.41 
 
 
378 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>