202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3620 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 353 aa  694    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  57.63 
 
 		 351 aa  336  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  38.01 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  41.59 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.55 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  42.73 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  35.1 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  36.89 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  34.81 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  37.28 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.9 
 
 		 364 aa  202  9e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  38.22 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.59 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.97 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  34 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  36.83 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  33.91 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  36.51 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  39.13 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  36.19 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  36.42 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  36.42 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  36.19 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  38.8 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  38.8 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  36.19 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  36.1 
 
 		 349 aa  186  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  36.1 
 
 		 349 aa  185  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  36.1 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  36.1 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  36.1 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  35.78 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  38.31 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.94 
 
 		 350 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  35.76 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  38.93 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  36.73 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.07 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  37.11 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  33.55 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  33.55 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  33.55 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  28.77 
 
 		 376 aa  169  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  34.64 
 
 		 361 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  35 
 
 		 361 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  34.64 
 
 		 361 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  34.64 
 
 		 361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  34.64 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.64 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  34.83 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  34.64 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  34.64 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  34.64 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  33.75 
 
 		 364 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  36.36 
 
 		 350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  37.63 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  35.4 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.64 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  33.8 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  35.01 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  33.02 
 
 		 364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  35.54 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  33.85 
 
 		 367 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  34.86 
 
 		 353 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.36 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.54 
 
 		 732 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  33.9 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.59 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.76 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.31 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.74 
 
 		 359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  30.25 
 
 		 381 aa  152  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  32.99 
 
 		 334 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.05 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  29.54 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.64 
 
 		 357 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.94 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.75 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1798  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.3 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.85 
 
 		 356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  32.28 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.86 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3548  malate/L-lactate dehydrogenase  32.11 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0039901  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.52 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0106  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.63 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  32.26 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.06 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  31.82 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1530  hypothetical protein  34.27 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  30.75 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.78 
 
 		 355 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.87 
 
 		 362 aa  143  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  34.89 
 
 		 369 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  34.89 
 
 		 369 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  34.89 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  31.96 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  34.68 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  34.53 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>