203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0235 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 355 aa  722    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  72.8 
 
 		 359 aa  548  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  65.45 
 
 		 357 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  65.25 
 
 		 381 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  59.21 
 
 		 361 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  48.45 
 
 		 364 aa  342  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  44.92 
 
 		 383 aa  289  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.5 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  36.75 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  38.92 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  36.03 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  40 
 
 		 372 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  38.03 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  37.72 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.62 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  44.92 
 
 		 732 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  35.34 
 
 		 348 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  34.93 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  34.38 
 
 		 345 aa  192  9e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  34.37 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  34.37 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.15 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  34.19 
 
 		 369 aa  182  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  35.21 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  32.87 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  33.43 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.02 
 
 		 353 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  35.41 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  33.98 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.07 
 
 		 353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  38.37 
 
 		 351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  32.97 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.38 
 
 		 361 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  33.15 
 
 		 361 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  33.79 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.86 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  33.24 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  33.92 
 
 		 368 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  31.42 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  30.38 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  30.68 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  31.99 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  31.99 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  31.99 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  30.38 
 
 		 361 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  30.38 
 
 		 361 aa  159  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  30.38 
 
 		 361 aa  159  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.38 
 
 		 361 aa  159  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  30.38 
 
 		 361 aa  159  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  30.38 
 
 		 361 aa  159  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  30.38 
 
 		 361 aa  159  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  33.61 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2457  malate/L-lactate dehydrogenase  38.24 
 
 		 356 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  30.81 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.62 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  30.81 
 
 		 349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  30.81 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  30.81 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3257  hypothetical protein  34.52 
 
 		 349 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal  0.244853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.36 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  32.64 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  32.76 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  30.03 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  32.18 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1601  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.65 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  32.19 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.11 
 
 		 349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.11 
 
 		 349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  30.55 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  29.68 
 
 		 364 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  31.18 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  31.05 
 
 		 369 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1446  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.74 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0751418 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  30.77 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  30.77 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3704  hypothetical protein  31.03 
 
 		 369 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305057  normal  0.776569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  29.75 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.76 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3802  malate/L-lactate dehydrogenase  32.38 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  35.2 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  30.48 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  30.23 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  34.68 
 
 		 332 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  28.78 
 
 		 349 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  34.68 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2132  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.96 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  28.78 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  28.78 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  28.78 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  32.15 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1632  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.2 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000326891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1845  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.48 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.957462  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  28.78 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  28.78 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  32.22 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  28.78 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  28.78 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  36.61 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>