202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0451 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  100 
 
 		 347 aa  694    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  95.68 
 
 		 347 aa  666    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  93.66 
 
 		 347 aa  656    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  83.72 
 
 		 345 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  66.08 
 
 		 345 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.87 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.89 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.13 
 
 		 364 aa  203  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  35.46 
 
 		 361 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.39 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.23 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  33.77 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.37 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.87 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  33.04 
 
 		 337 aa  185  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  31.94 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  33.62 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.71 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  31.34 
 
 		 376 aa  179  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.47 
 
 		 359 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.13 
 
 		 383 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 367 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  34.5 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  31.96 
 
 		 351 aa  173  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.23 
 
 		 364 aa  172  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  32.83 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.92 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  32.28 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  35 
 
 		 351 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  32.04 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  32.34 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  32.04 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  32.04 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  32.74 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.6 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  32.74 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  32.74 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.8 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  31.05 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  32.14 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0106  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.55 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  30.12 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.79 
 
 		 360 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  30.42 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  33.1 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  30.12 
 
 		 349 aa  159  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  30.12 
 
 		 349 aa  159  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  30.42 
 
 		 349 aa  159  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  30.42 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  30.42 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  30.42 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  31.62 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1634  hypothetical protein  27.75 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849275  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  33.04 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  32.62 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  31.49 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  31.33 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0576  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.23 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.939938  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2457  malate/L-lactate dehydrogenase  35.91 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  33.04 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.04 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  33.04 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  28.24 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.05 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  33.04 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  33.04 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  32.74 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  33.04 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  33.04 
 
 		 361 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  29.78 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.71 
 
 		 732 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.29 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.19 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3293  malate/L-lactate dehydrogenase  28.28 
 
 		 360 aa  149  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769651  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  29.74 
 
 		 348 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.57 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.57 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.16 
 
 		 353 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1597  2,3-diketo-L-gulonate reductase  30.86 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  32.9 
 
 		 349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  30.14 
 
 		 361 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.49 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  29.91 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  29.91 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.97 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  31.87 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  30.23 
 
 		 367 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  33.84 
 
 		 339 aa  143  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  27.89 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0711  malate/L-lactate dehydrogenase  30.21 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.707221  normal  0.854883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  29.91 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  29.91 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  29.61 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.17 
 
 		 361 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0759  2,3-diketo-L-gulonate reductase  30.58 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54834  dehydrogenase  32.51 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03427  2,3-diketo-L-gulonate dehydrogenase, NADH-dependent  28.53 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0135  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.53 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0139  2,3-diketo-L-gulonate reductase  28.53 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3779  2,3-diketo-L-gulonate reductase  28.53 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>