202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3304 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  100 
 
 		 336 aa  691    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  78.68 
 
 		 335 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  78.68 
 
 		 335 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  78.68 
 
 		 335 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  40.73 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  40.73 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  40.43 
 
 		 349 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  40.43 
 
 		 349 aa  259  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  40.43 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  40.12 
 
 		 349 aa  259  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  40.73 
 
 		 349 aa  259  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  40.73 
 
 		 349 aa  259  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  39.21 
 
 		 349 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  38.91 
 
 		 349 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  39.21 
 
 		 349 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  38.91 
 
 		 349 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.65 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  34.78 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  36.16 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.83 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  33.54 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.54 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.54 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  33.83 
 
 		 348 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  31.42 
 
 		 351 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  34.53 
 
 		 348 aa  178  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2457  malate/L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  32.57 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  30.96 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.54 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.04 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.53 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.31 
 
 		 732 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  31.12 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.97 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  31.12 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  33.77 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  31.91 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  29.43 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  31.11 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  30.36 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3257  hypothetical protein  31.23 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal  0.244853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.31 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.08 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.18 
 
 		 355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  29.65 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.03 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.34 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  29.82 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  31.89 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  31.6 
 
 		 345 aa  149  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  31.8 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  28.35 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  30.89 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  31.01 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  30.21 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1065  malate/L-lactate dehydrogenase  30.65 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.65 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.7 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3061  malate/L-lactate dehydrogenase  29.89 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  31.49 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.03 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3587  malate/L-lactate dehydrogenase  30.52 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.787615  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.41 
 
 		 383 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.75 
 
 		 355 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1710  malate/L-lactate dehydrogenase  29.43 
 
 		 361 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6488  malate/L-lactate dehydrogenase  28.94 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.542487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1699  malate/L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2943  hypothetical protein  30.46 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  27.79 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.8 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  28.92 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  30 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  28.75 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21420  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.11 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1498  hypothetical protein  30.4 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  28.53 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.71 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  30 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.46 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  31.33 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  28.96 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  29.12 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  26.92 
 
 		 358 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  28.06 
 
 		 362 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.06 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6385  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.02 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.738936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  25.51 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  28.62 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  26.32 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  27.38 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1530  hypothetical protein  31.63 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  26.2 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  28.35 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  29.2 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1400  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.51 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29499  predicted protein  30.62 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.096211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3968  hypothetical protein  31.14 
 
 		 364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>