201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4866 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  686    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3870  malate/L-lactate dehydrogenase  79.1 
 
 		 345 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6385  Malate/L-lactate dehydrogenase  76.76 
 
 		 344 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.738936 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  74.12 
 
 		 345 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  69.71 
 
 		 343 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0219  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  68.24 
 
 		 319 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  70.96 
 
 		 344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  52.42 
 
 		 336 aa  342  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  51.2 
 
 		 334 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  52.41 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  52.81 
 
 		 344 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  52.81 
 
 		 344 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  52.81 
 
 		 344 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  50.15 
 
 		 340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  52.81 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  52.81 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3323  malate/L-lactate dehydrogenase  49.85 
 
 		 348 aa  325  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.115763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  49.85 
 
 		 340 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  49.85 
 
 		 340 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  49.85 
 
 		 340 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  49.85 
 
 		 340 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  49.55 
 
 		 340 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  49.53 
 
 		 337 aa  322  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  51.56 
 
 		 344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  51.25 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  52.17 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  42.24 
 
 		 356 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  42.48 
 
 		 343 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  43.86 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  41.74 
 
 		 341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  43.11 
 
 		 350 aa  235  7e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  41.74 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  41.74 
 
 		 341 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  41.14 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  41.67 
 
 		 343 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  42.48 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  38.1 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2116  malate/L-lactate dehydrogenase  38.66 
 
 		 339 aa  206  7e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  39.32 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.17 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  34.63 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  36.94 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.87 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  39.81 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  34.56 
 
 		 336 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  38.27 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.85 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  34.81 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.55 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  32.12 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2141  malate/L-lactate dehydrogenase  36.55 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437506  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.02 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  34.49 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.42 
 
 		 349 aa  145  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5101  malate/L-lactate dehydrogenase  35.39 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.540647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  30.81 
 
 		 351 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.04 
 
 		 732 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.48 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  28.45 
 
 		 351 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  34.81 
 
 		 334 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  32.27 
 
 		 348 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  29.47 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  29.47 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  29.47 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  30.88 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  28.62 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  34.67 
 
 		 349 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.48 
 
 		 360 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.92 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  32.26 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  32.26 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  31.9 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  34.63 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.63 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.63 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  31.9 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  31.67 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  31.67 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5737  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.68 
 
 		 367 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  31.67 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  30.28 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  28.06 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  31.54 
 
 		 349 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  31.89 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  28.52 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  32.97 
 
 		 369 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  32.97 
 
 		 369 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.33 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.37 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  32.62 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.33 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  32.62 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.68 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  26.03 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  29.35 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  33.47 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  30.32 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  30.32 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  30.32 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  30.32 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.131047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>