203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2899 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2899  malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
343 aa  689    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  70.72 
 
 
345 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6385  Malate/L-lactate dehydrogenase  70.47 
 
 
344 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.738936 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4866  malate/L-lactate dehydrogenase  69.71 
 
 
343 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.871504 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3870  malate/L-lactate dehydrogenase  69.86 
 
 
345 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0941  malate/L-lactate dehydrogenase  67.06 
 
 
344 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0219  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  64.35 
 
 
319 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5095  malate/L-sulfolactate dehydrogenase  57.44 
 
 
336 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48020  putative L-malate dehydrogenase  55.26 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00543766  normal  0.806598 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4028  malate/L-lactate dehydrogenase  54.18 
 
 
340 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0113292  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4140  putative L-malate dehydrogenase  55.56 
 
 
334 aa  348  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1423  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  55.59 
 
 
344 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4230  malate/L-lactate dehydrogenase  53.56 
 
 
340 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4136  malate/L-lactate dehydrogenase  53.56 
 
 
340 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00167643  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2191  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  55.59 
 
 
344 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0876  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  55.59 
 
 
344 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0467  malate/L-lactate dehydrogenase  55.59 
 
 
344 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3547  malate/L-lactate dehydrogenase  53.03 
 
 
340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312581  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0565  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  55.59 
 
 
344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1898  malate/L-lactate dehydrogenase  52.94 
 
 
340 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3383  malate/L-lactate dehydrogenase  52.94 
 
 
340 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.245063 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3323  malate/L-lactate dehydrogenase  52.2 
 
 
348 aa  338  7e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.115763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1835  malate/L-lactate dehydrogenase  51.54 
 
 
337 aa  338  8e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722064  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4451  malate/L-lactate dehydrogenase  52.31 
 
 
340 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.932071  normal  0.983575 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2071  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  53.73 
 
 
344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1882  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  54.94 
 
 
346 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  44.48 
 
 
356 aa  272  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  45.26 
 
 
332 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  44.44 
 
 
343 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  44.05 
 
 
341 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  45.59 
 
 
341 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  45.05 
 
 
343 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  43.75 
 
 
341 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  44.44 
 
 
343 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  46.63 
 
 
350 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  45.88 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2116  malate/L-lactate dehydrogenase  40.06 
 
 
339 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  41.52 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  37.87 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  39.01 
 
 
339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3386  malate/L-lactate dehydrogenase  37.69 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  40.84 
 
 
329 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  34.26 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.71 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  38.87 
 
 
329 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.42 
 
 
356 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.76 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  33.82 
 
 
351 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.38 
 
 
332 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  35.74 
 
 
333 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  34.25 
 
 
337 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.76 
 
 
732 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  34.24 
 
 
352 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.7 
 
 
349 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  32.86 
 
 
335 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  32.86 
 
 
335 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  31.8 
 
 
336 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  32.86 
 
 
335 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  32.9 
 
 
353 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 
348 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 
349 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5101  malate/L-lactate dehydrogenase  35.08 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.540647 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  37.23 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  28.19 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.75 
 
 
353 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.12 
 
 
383 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.35 
 
 
344 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4341  hypothetical protein  33.1 
 
 
369 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2141  malate/L-lactate dehydrogenase  34.42 
 
 
328 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437506  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0783  hypothetical protein  33.1 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256957  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  29.69 
 
 
345 aa  136  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  30.15 
 
 
349 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3456  hypothetical protein  32.81 
 
 
369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0477339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4910  hypothetical protein  32.81 
 
 
369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  34.41 
 
 
349 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.16 
 
 
349 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.16 
 
 
349 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  28.24 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  34.41 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  34.41 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.67 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5376  hypothetical protein  32.81 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0371225  normal  0.0812786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  34.01 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4858  hypothetical protein  32.38 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256767  hitchhiker  0.00905193 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  28.69 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  33.86 
 
 
368 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6588  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.72 
 
 
378 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3548  malate/L-lactate dehydrogenase  30.21 
 
 
358 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0039901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  34.41 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  34.41 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  34.41 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  34.41 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  27.46 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  34.41 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  35.16 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  34.41 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  34.41 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  30.27 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  26.61 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  34.01 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>