203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1965 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1965  Malate/L-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 349 aa  717    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4412  Malate dehydrogenase  40.82 
 
 		 351 aa  288  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2563  Malate dehydrogenase  37.04 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0709444  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07633  malate/L-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13810)  37.11 
 
 		 361 aa  228  9e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.571482 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0724  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  39.08 
 
 		 353 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3620  Malate/L-lactate dehydrogenase  36.55 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1791  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.65 
 
 		 334 aa  219  7e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5908  malate/L-lactate dehydrogenase  36.23 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767932  normal  0.259263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5655  malate/L-lactate dehydrogenase  36.86 
 
 		 349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.64858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0574  ureidoglycolate dehydrogenase  34.86 
 
 		 349 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3719  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.16 
 
 		 349 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4649  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  37.16 
 
 		 349 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2546  dehydrogenase  35.42 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637789  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0581  ureidoglycolate dehydrogenase  34.56 
 
 		 349 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0635  ureidoglycolate dehydrogenase  34.56 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2541  malate/L-lactate dehydrogenase  37.58 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0576  ureidoglycolate dehydrogenase  34.56 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0410  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.2 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2039  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  34.86 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308465  normal  0.10893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0555  ureidoglycolate dehydrogenase  33.75 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3096  ureidoglycolate dehydrogenase  33.33 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0562  ureidoglycolate dehydrogenase  33.75 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0618  ureidoglycolate dehydrogenase  33.44 
 
 		 349 aa  202  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00467  ureidoglycolate dehydrogenase  33.75 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3105  ureidoglycolate dehydrogenase  33.44 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  35.35 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521695  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00472  hypothetical protein  33.75 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0591  ureidoglycolate dehydrogenase  33.44 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.560596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0235  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.09 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752224  normal  0.0613067 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4453  malate/L-lactate dehydrogenase  35.74 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3898  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.03 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1534  malate/L-lactate dehydrogenase  32.93 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.975187  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4123  malate dehydrogenase (NAD)  34.62 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1771  malate dehydrogenase (NADP+)  37.71 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0451  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  33.23 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3304  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  32.59 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0489391 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0600  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.75 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0455  malate/L-lactate dehydrogenase  33.03 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0385  malate/L-lactate dehydrogenase  32.93 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.214984 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3327  ureidoglycolate dehydrogenase  32.08 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.388816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3319  ureidoglycolate dehydrogenase  32.08 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.910608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3243  ureidoglycolate dehydrogenase  32.08 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1995  Malate/L-lactate dehydrogenase  34.42 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0558  L-sulfolactate dehydrogenase  33.63 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.899943  normal  0.297521 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5976  malate/L-lactate dehydrogenase  41.98 
 
 		 329 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3707  Malate/L-lactate dehydrogenase  40.7 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1015  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.91 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.759663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1029  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.89 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5261  malate/L-lactate dehydrogenase  40.41 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5300  malate/L-lactate dehydrogenase  34.39 
 
 		 352 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3527  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.56 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5012  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.44 
 
 		 359 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3531  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  33.72 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0241  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  36.56 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0320  malate dehydrogenase (NAD)  31.53 
 
 		 381 aa  179  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2460  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.74 
 
 		 332 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.462463  normal  0.424156 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6359  malate/L-lactate dehydrogenase  33.82 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0106  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  35.71 
 
 		 346 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4997  (R)-2-hydroxyacid dehydrogenase  34.31 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2359  ureidoglycolate dehydrogenase  34.33 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2567  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  33.43 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0890  malate dehydrogenase (NADP(+))  33.94 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.416405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3802  malate/L-lactate dehydrogenase  33.83 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00768  predicted dehydrogenase  32.95 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2841  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.95 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2551  hypothetical protein  32.67 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00785  hypothetical protein  32.95 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0856  hypothetical protein  32.95 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2842  hypothetical protein  32.95 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0825  hypothetical protein  32.95 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0950  hypothetical protein  32.95 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2181  malate/L-lactate dehydrogenase  33.23 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0869  hypothetical protein  32.66 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0715  malate/L-lactate dehydrogenase  28.85 
 
 		 358 aa  166  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0248674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3821  Malate/L-lactate dehydrogenase  37.02 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1014  Malate/L-lactate dehydrogenase  31.86 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6875  Malate/L-lactate dehydrogenase  28.98 
 
 		 357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.366765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3591  malate/L-lactate dehydrogenase  33.13 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.127948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2325  malate/L-lactate dehydrogenase  32.93 
 
 		 341 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5456  hypothetical protein  31.43 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3020  malate/L-lactate dehydrogenase  30.57 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12130  malate dehydrogenase (NAD)  29.74 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1356  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.66 
 
 		 353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.989483  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0618  Malate/L-lactate dehydrogenase  32.68 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7014  malate dehydrogenase  31.38 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2143  malate/L-lactate dehydrogenase  32.16 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1122  L-sulfolactate dehydrogenase / malate dehydrogenase (NAD)  32.6 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5277  hypothetical protein  30.65 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0968359  normal  0.077183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6157  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.77 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3789  Malate/L-lactate dehydrogenase  30.46 
 
 		 732 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16820  malate dehydrogenase (NAD)  28.21 
 
 		 376 aa  159  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2481  Malate/L-lactate dehydrogenase  33.73 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2116  malate/L-lactate dehydrogenase  34.3 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4855  malate/L-lactate dehydrogenase  33.03 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.245039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3134  delta1-piperideine 2-carboxylate reductase  33.73 
 
 		 350 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0782  hypothetical protein  31.25 
 
 		 353 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2010  hypothetical protein  31.75 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  0.0216387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2806  malate/L-lactate dehydrogenase  32.02 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0240  malate/L-lactate dehydrogenase family protein  30.24 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0559  malate/L-lactate dehydrogenase  31.14 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>